GraphTransformer 开源项目教程

GraphTransformer 开源项目教程

graphtransformerGraph Transformer Architecture. Source code for "A Generalization of Transformer Networks to Graphs", DLG-AAAI'21.项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/gr/graphtransformer

1. 项目的目录结构及介绍

graphtransformer/
├── README.md
├── setup.py
├── requirements.txt
├── graphtransformer/
│   ├── __init__.py
│   ├── main.py
│   ├── config.py
│   ├── models/
│   │   ├── __init__.py
│   │   ├── graph_transformer.py
│   ├── utils/
│   │   ├── __init__.py
│   │   ├── data_loader.py
│   │   ├── metrics.py

• README.md: 项目介绍和使用说明。
• setup.py: 项目安装脚本。
• requirements.txt: 项目依赖包列表。
• graphtransformer/: 项目主目录。
  • __init__.py: 模块初始化文件。
  • main.py: 项目启动文件。
  • config.py: 项目配置文件。
  • models/: 模型相关文件。
    • graph_transformer.py: 图转换器模型定义。
  • utils/: 工具函数和类。
    • data_loader.py: 数据加载器。
    • metrics.py: 评估指标计算。

2. 项目的启动文件介绍

main.py 是项目的启动文件，负责初始化配置、加载数据、训练和评估模型。以下是 main.py 的主要功能模块：

import argparse
from graphtransformer.config import Config
from graphtransformer.models.graph_transformer import GraphTransformer
from graphtransformer.utils.data_loader import DataLoader
from graphtransformer.utils.metrics import evaluate

def main():
    parser = argparse.ArgumentParser(description="Graph Transformer")
    parser.add_argument('--config', type=str, default='config.json', help='Path to the config file.')
    args = parser.parse_args()

    config = Config(args.config)
    data_loader = DataLoader(config)
    model = GraphTransformer(config)

    # 训练和评估模型
    model.train(data_loader)
    evaluate(model, data_loader)

if __name__ == "__main__":
    main()

• argparse: 解析命令行参数。
• Config: 加载配置文件。
• GraphTransformer: 初始化模型。
• DataLoader: 加载数据。
• evaluate: 评估模型性能。

3. 项目的配置文件介绍

config.py 负责加载和管理项目的配置参数。以下是 config.py 的主要功能模块：

import json

class Config:
    def __init__(self, config_path):
        with open(config_path, 'r') as f:
            self.config = json.load(f)

    def get_config(self):
        return self.config

    def __getitem__(self, key):
        return self.config[key]

• json: 读取 JSON 格式的配置文件。
• Config: 配置类，负责加载和提供配置参数。

配置文件示例 (config.json):

{
    "learning_rate": 0.001,
    "batch_size": 32,
    "num_epochs": 100,
    "hidden_dim": 128,
    "num_heads": 4,
    "dropout": 0.1
}

• learning_rate: 学习率。
• batch_size: 批处理大小。
• num_epochs: 训练轮数。
• hidden_dim: 隐藏层维度。
• num_heads: 注意力头数。
• dropout: dropout 比例。

graphtransformerGraph Transformer Architecture. Source code for "A Generalization of Transformer Networks to Graphs", DLG-AAAI'21.项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/gr/graphtransformer