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原创 DEGAS:将临床属性转移到细胞

通过整合single-cell与bulk将临床标签转移到cell

2024-07-21 12:37:53 604

原创 MOGONET:患者分类与biomarker识别

有标签的配对数据整合

2024-07-19 23:14:52 587

原创 CLAM用于弱监督WSI分析

CLAM:注意力MIL用于WSI

2024-07-04 19:54:09 949

原创 TransMIL:基于Transformer的多实例学习

TransMIL

2024-07-02 22:13:33 940

原创 BioCLIP:物种图像的基础视觉模型

以分类学name组成句子结合CLIP分类生命树

2024-06-27 22:49:16 987

原创 LangCell:用于细胞注释的语言-细胞预训练模型

细胞-文本检索实现零样本细胞注释

2024-06-27 15:07:04 657

原创 Cell2Sentence:为LLM传输生物语言

设计自然语言LLM支持的生物语言并微调

2024-06-24 17:10:00 731

原创 AlphaMissense:预测错义变异的致病性

AlphaMissense预测错义变异致病性

2024-06-22 14:00:52 780

原创 从Instance classifier重新思考多实例学习

弱监督多实例对比学习

2024-06-17 13:15:06 924

原创 基于注意力的MIL

AttentionMIL

2024-06-13 19:13:52 643

原创 Multimodal Dynamics:用于多模态融合背景下的分类

利用不确定性在联合场景下处理多模态融合

2024-06-12 21:48:05 898 1

原创 LaDM3IL:多实例学习用于免疫库分类

MIL应用:免疫库分类

2024-06-11 21:38:16 888

原创 DT-MIL:用于组织病理学图像的MIL方法

WSI与MIL

2024-06-07 16:49:13 707

原创 SIMBA方法解读

simba方法解读

2024-06-06 22:16:48 955

原创 SEACells:元细胞分析

SEACells:元细胞

2024-06-06 12:06:00 1101

原创 scGPT实验解读

scGPT的实验解读

2024-06-02 20:28:53 1093

原创 SIMBA:单细胞嵌入与特征

SIMBA:细胞与特征embedding联合学习

2024-06-02 17:23:49 951

原创 scButterfly:单细胞跨模态翻译

scButterfly-跨模态翻译

2024-06-01 14:49:15 932

原创 UnpairReg:回归分析用于不配对多组学分析

UnpairReg:推断调控系数+ATAC预测RNA

2024-05-29 23:28:58 1014

原创 Mowgli用于配对多组学整合

iNMF-based配对整合

2024-05-28 20:26:21 971

原创 5.基于python的scRNA-seq细胞状态分析-细胞扰动

scRNA-seq细胞扰动分析

2024-05-28 14:34:09 998

原创 融合基因组序列识别scATAC-seq的细胞类型

SANGO:scATAC-seq注释

2024-05-22 21:30:15 966

原创 5.基于python的scRNA-seq细胞状态分析-细胞组成

scRNA-seq细胞组成分析

2024-05-22 20:32:30 723

原创 5.基于python的scRNA-seq细胞状态分析-差异表达

scRNA-seq差异表达分析

2024-05-22 14:09:42 696

原创 4.基于python的scRNA-seq轨迹推断-RNA速率

scRNA-seq估计RNA速率+伪时间估计

2024-05-19 17:53:07 802

原创 4.基于python的scRNA-seq轨迹推断-伪时间计算

scRNA-seq伪时间计算+PAGA模拟轨迹

2024-05-19 14:01:30 543

原创 3.基于python的scRNA-seq细胞类型注释-自动注释(从参考到查询)

scRNA-seq自动注释-参考到查询

2024-05-18 21:45:29 699

原创 3.基于python的scRNA-seq细胞类型注释-自动注释

scRNA-seq自动注释

2024-05-18 18:28:54 1089

原创 3.基于python的scRNA-seq细胞类型注释-手动注释

scRNA-seq手动注释

2024-05-17 17:11:47 810

原创 2.基于Python的单细胞转录组数据处理-批次整合

scRNA-seq数据处理-批次整合

2024-05-16 18:11:09 883

原创 MLP的代替:KAN

代替MLP的KAN

2024-05-14 14:11:49 1537

原创 1.基于python的单细胞数据预处理-降维可视化

scRNA-seq预处理-降维可视化

2024-05-11 18:06:34 829 1

原创 1.基于python的单细胞数据预处理-特征选择

scRNA-seq预处理-HVG选择

2024-05-10 23:34:20 726 2

原创 1.基于python的单细胞数据预处理-归一化

scRNA-seq预处理-归一化

2024-05-10 20:29:09 927

原创 1.基于python的单细胞数据预处理-质量控制

scRNA-seq预处理-质量控制

2024-05-09 17:33:07 1049 1

原创 在单细胞分辨率下预测细胞对新型药物扰动的反应

药物刺激的细胞状态扰动预测

2024-05-01 22:07:36 785

原创 跨领域的小样本药物发现基准

小样本药物发现基准MetaMol-Net

2024-04-09 18:53:16 816

原创 scFed:联邦学习用于scRNA-seq分类

联邦学习用于细胞分类

2024-04-09 16:29:15 1301 1

原创 元学习结合图神经网络用于药物发现

小样本分子性质预测Meta-GAT

2024-04-09 13:47:00 826 1

原创 从多模态生物图数据中学习Gene的编码-MuSeGNN

MuSe-GNN+基因embedding分析

2024-04-05 15:36:28 1124

红楼梦人物图谱csv文件

红楼梦人物图谱csv文件

2023-08-30

mackey_glass_t17.npy

Mackey-Glass (MG)序列的部分内容,shape为(10000,),这个时间序列是混乱的,没有明确的周期。 级数不收敛也不发散,轨迹对初始条件高度敏感。 这个基准问题用于神经网络和模糊建模研究。

2021-07-12

Kaggle交易预测.rar

基于 Kaggle 竞赛数据,原始数据文件较大,故本数据集只选用了 train.csv 中的 5 万条样本作为模型训练集(train.csv.gzip),1 万条样本作为模型测试集(test.csv.gzip)

2021-02-17

olivetti_py3.pkz

人脸图像数据集 olivetti_py3.pkz,该数据集一共有 400 张人脸图片,每张图片的大小是:64x64,每张图片作为一个样本,一共有 400 个样本,每个样本的特征维度是:64x64 = 4096;400 张图片一共包含 40 个不同的人,每个人有 10 张人脸图片

2021-02-13

随机森林评估特征重要性wine.rar

基于 UCI 葡萄酒数据,使用随机森林进行特征重要性分析,这些数据是对意大利同一地区种植的三种不同品种葡萄酒的化学分析结果,分析确定了三种葡萄酒中13种成分的含量,数据的第一列是葡萄酒的类别

2021-02-02

决策树预测用户流失data.csv

基于某信息公司的用户数据,使用决策树预测用户是否会流失,字段Churn代表客户是否流失,取值:['Yes', 'No'],其余字段为特征

2021-02-01

基于朴素贝叶斯的垃圾邮件过滤data.rar

邮件数据包括训练集train(正常邮件normal,垃圾邮件spam),测试集test,中文停用词文件cn_stopwords.txt

2021-01-31

LR预测CTR数据集data.zip

数据集是电商领域数据集,共计200万的样本记录。原始特征均为ID类特征; 字段说明: userid 用户ID itemid 商品ID categoryid 商品类目ID action 用户行为类型 timestamp 时间戳

2021-01-25

机器翻译nmt.zip

轻量级机器翻译数据集,en-cn为英文与中文,en-fr为英文与法文

2021-01-22

nltk_data.rar

nltk的分词工具,将其解压,放置到当前虚拟环境(假设环境名为TORCH),则目录结构为"TORCH/nltk_data/tokenizers/punkt"

2021-01-22

google.csv

机器学习第六课,使用线性回归预测未来30天 Google 股票的收盘价走势,表格中的列代表每天的股票指数,如:Open 开盘价、High 最高价、Low 最低价、Volume 成交量。Adj. Open、Adj. High、Adj. Low、Adj. Close、Adj. Volume 代表调整后的数据

2021-01-15

hymenoptera_data.zip

hymenoptera_data数据集,这个数据集包括两类图片, bees 和 ants, 这些数据都被处理成了可以使用"torchvision.datasets.ImageFolder"来读取的格式。

2020-12-02

glove.6B.100d.txt.zip

glove.6B是斯坦福大学训练的词向量包(862MB),glove.6B.100d是100维词向量,TEXT.build_vocab可以根据我自己的词汇表内的词匹配到glove内的词,组建成为需要的词向量;后面如果想使用这个新词向量,可以通过TEXT.vocab.vectors返回

2020-11-29

MNIST与FashionMNIST数据集

数据集包括了MNIST和FashionMNIST,有原始数据集raw和经过torchvision.datasets处理过的processed目录

2020-11-29

TextSet.zip

该文件用于词向量训练,Skip-Gram训练,主要是texttrain.txt文件,训练细节见白景屹的Pytorch笔记本-第四课.词向量:https://blog.csdn.net/qq_40943760/category_10532835.html

2020-11-09

fasterRCNN口罩检测

使用fasterrcnn实现口罩检测,fasterrcnn基于keras搭建,训练需要口罩数据集,数据集必须是VOC格式,预测需要权重文件,权重文件已经存在

2020-05-26

空空如也

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