DDPM-Proteins 开源项目教程

DDPM-Proteins 开源项目教程

ddpm-proteinsA denoising diffusion probabilistic model (DDPM) tailored for conditional generation of protein distograms项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/dd/ddpm-proteins

1. 项目的目录结构及介绍

ddpm-proteins/
├── README.md
├── requirements.txt
├── setup.py
├── data/
│   ├── __init__.py
│   └── dataset.py
├── models/
│   ├── __init__.py
│   └── ddpm.py
├── scripts/
│   ├── train.py
│   └── evaluate.py
├── configs/
│   ├── default.yaml
│   └── custom.yaml
└── tests/
    ├── __init__.py
    └── test_ddpm.py
  • README.md: 项目说明文件,包含项目的基本信息和使用指南。
  • requirements.txt: 项目依赖文件,列出了运行项目所需的Python包。
  • setup.py: 项目的安装脚本,用于安装项目及其依赖。
  • data/: 数据处理模块,包含数据集的加载和预处理代码。
  • models/: 模型定义模块,包含扩散模型(DDPM)的实现。
  • scripts/: 脚本模块,包含训练和评估模型的脚本。
  • configs/: 配置文件模块,包含默认和自定义的配置文件。
  • tests/: 测试模块,包含对模型和数据处理的测试代码。

2. 项目的启动文件介绍

  • scripts/train.py: 训练模型的启动文件,用于启动模型的训练过程。
  • scripts/evaluate.py: 评估模型的启动文件,用于评估模型的性能。

3. 项目的配置文件介绍

  • configs/default.yaml: 默认配置文件,包含模型的默认参数设置。
  • configs/custom.yaml: 自定义配置文件,用户可以根据需要修改参数以适应不同的训练需求。

以上是 ddpm-proteins 开源项目的目录结构、启动文件和配置文件的介绍。希望这些信息能帮助你更好地理解和使用该项目。

ddpm-proteinsA denoising diffusion probabilistic model (DDPM) tailored for conditional generation of protein distograms项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/dd/ddpm-proteins

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