SYBYL-X 2.0软件基础应用及3D-QSAR模型构建使用说明

最新推荐文章于 2024-10-31 14:38:04 发布

薄思悦

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SYBYL-X 2.0软件基础应用及3D-QSAR模型构建使用说明

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资源文件描述

本资源文件详细介绍了SYBYL-X 2.0软件的基础应用以及3D-QSAR模型的构建过程。内容涵盖了软件的默认路径设置、分子结构绘图、分子结构的导出与保存、分子结构的导入及显示、小分子表单的创建及更新、小分子表单的导出、小分子力场优化、分子叠合、比较分子场分析（CoMFA）和比较分子相似性分析（CoMSIA）的构建、CoMFA和CoMSIA等势图的显示、预测值和实际值差的计算等具体步骤。所有操作均以图文并茂的PDF形式呈现，方便用户对照操作进行相关模型的构建。

内容概述

软件默认路径设置：详细介绍了如何设置SYBYL-X 2.0的默认路径，确保软件能够正确读取和保存文件。
分子结构绘图：通过图文结合的方式，指导用户如何在SYBYL-X 2.0中绘制分子结构，并进行必要的编辑和优化。
分子结构导出与保存：介绍了如何将绘制好的分子结构导出为常见的文件格式，并保存到指定路径。
分子结构导入及显示：指导用户如何将外部分子结构文件导入SYBYL-X 2.0，并在软件中进行显示和编辑。
小分子表单的创建及更新：详细说明了如何创建和更新小分子表单，以便进行后续的分析和处理。
小分子表单的导出：介绍了如何将小分子表单导出为可编辑的文件格式，方便用户进行进一步的数据处理。
小分子力场优化：通过图文结合的方式，指导用户如何对小分子进行力场优化，以获得更准确的分子结构。
分子叠合：详细说明了分子叠合的操作步骤，帮助用户将多个分子结构进行精确对齐。
比较分子场分析（CoMFA）和比较分子相似性分析（CoMSIA）构建：介绍了如何使用SYBYL-X 2.0构建CoMFA和CoMSIA模型，并进行相应的分析。
CoMFA和CoMSIA等势图显示：指导用户如何显示CoMFA和CoMSIA的等势图，以便直观地观察分子场和相似性分析结果。
预测值和实际值差计算：详细说明了如何计算预测值和实际值之间的差异，帮助用户评估模型的准确性。