Discovery Studio™ (简称DS)是专业的生命科学分子模拟软件,DS目前的主要功能包括:蛋白质的表征(包括蛋白-蛋白相互作用)、同源建模、分子力学计算和分子动力学模拟、基于结构药物设计工具(包括配体-蛋白质相互作用、全新药物设计和分子对接)、基于小分子的药物设计工具(包括定量构效关系、药效团、数据库筛选、ADMET)和组合库的设计与分析等。
3D-QSAR 方法更能间接反映配体小分子和蛋白大分子之间的非键相互作用特征,具有丰富的物理化学内涵。这里利刃君为大家带来基于小分子的立体(steric)和静电(electrostatic)场构建3D-QSAR模型的教程。
模型构建
1.3D-QSAR的构建
①导入训练集分子
在文件浏览器中,点击Samples>Tutorials>QSAR,双击trainingset.sd,导入本次教程所需的14个训练集分子。②导入测试集分子
在文件浏览器中,点击Samples>Tutorials>QSAR,双击testset.sd,导入8个测试集分子。
- 训练集分子与测试集分子均事先进行了叠合,一般可直接基