QVina项目推荐
qvina Accurately speed up AutoDock Vina 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/qv/qvina
1. 项目基础介绍和主要编程语言
QVina是一个开源项目,旨在通过加速AutoDock Vina来提高分子对接的效率和准确性。该项目主要使用C++和C语言进行开发,同时也包含一些Makefile脚本。QVina项目包括两个主要工具:QuickVina 2和QuickVina-W,它们都是基于AutoDock Vina的改进版本。
2. 项目的核心功能
QVina的核心功能是通过加速AutoDock Vina来实现更快速和更准确的分子对接。具体来说,QuickVina 2在保持高准确性的同时,成功实现了对AutoDock Vina的20.49倍加速。QuickVina-W则进一步扩展了功能,特别适用于宽搜索空间,尤其是在盲对接的情况下。
3. 项目最近更新的功能
QVina项目最近更新的功能主要集中在QuickVina-W的改进上。QuickVina-W通过引入全局缓冲区,允许搜索线程之间进行通信,从而提高了搜索的速度和敏感性。这一改进使得QuickVina-W在宽搜索空间中表现更为出色,特别是在盲对接的情况下。此外,项目还进行了一些性能优化和bug修复,以确保工具的稳定性和可靠性。
qvina Accurately speed up AutoDock Vina 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/qv/qvina