PaDELPy 安装和配置指南

PaDELPy 安装和配置指南

padelpy A Python wrapper for PaDEL-Descriptor software 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/pa/padelpy

1. 项目基础介绍和主要编程语言

项目基础介绍

PaDELPy 是一个用于计算分子描述符和指纹的 Python 包装器，它允许用户通过 Python 直接访问 PaDEL-Descriptor 软件的命令行接口。PaDEL-Descriptor 是一个广泛使用的分子描述符计算工具，而 PaDELPy 则简化了在 Python 环境中使用该工具的过程。

主要编程语言

PaDELPy 主要使用 Python 编程语言。

2. 项目使用的关键技术和框架

关键技术

• PaDEL-Descriptor: 这是一个用于计算分子描述符和指纹的 Java 软件。
• Python: 用于编写 PaDELPy 包装器的主要编程语言。
• Java Runtime Environment (JRE): 由于 PaDEL-Descriptor 是基于 Java 的，因此需要安装 JRE 6 或更高版本。

框架

• Python 标准库: 用于实现与 PaDEL-Descriptor 的交互。
• pip: Python 的包管理工具，用于安装 PaDELPy。

3. 项目安装和配置的准备工作和详细安装步骤

准备工作

1. 安装 Python: 确保你的系统上已经安装了 Python 3.6 或更高版本。你可以通过以下命令检查 Python 版本：

   python --version
   

   如果没有安装，可以从 Python 官方网站 下载并安装。

2. 安装 Java Runtime Environment (JRE): 由于 PaDEL-Descriptor 是基于 Java 的，因此需要安装 JRE 6 或更高版本。你可以从 Oracle 官方网站 下载并安装。

详细安装步骤

方法一：通过 pip 安装

1. 打开终端或命令提示符。
2. 运行以下命令安装 PaDELPy：

   pip install padelpy
   

方法二：通过克隆 GitHub 仓库安装

1. 打开终端或命令提示符。
2. 克隆 PaDELPy 的 GitHub 仓库：

   git clone https://github.com/ecrl/padelpy.git
   

3. 进入克隆的目录：

   cd padelpy
   

4. 使用 pip 安装 PaDELPy：

   pip install .
   

配置和使用

安装完成后，你可以通过以下 Python 代码示例来使用 PaDELPy：

from padelpy import from_smiles

# 计算丙烷的分子描述符
descriptors = from_smiles('CCC')
print(descriptors)

其他功能

PaDELPy 还提供了其他功能，如从 MDL MolFile 和 SDF 文件中获取描述符和指纹，以及通过命令行接口直接控制 PaDEL-Descriptor。详细的使用方法可以参考 PaDELPy 的 GitHub 页面。

通过以上步骤，你应该能够成功安装和配置 PaDELPy，并开始使用它来计算分子描述符和指纹。

padelpy A Python wrapper for PaDEL-Descriptor software 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/pa/padelpy