MaxENT简单实用教程来啦,从零到一

  1. 数据准备

1.1 物种分布信息

上电子标本库搜标本经纬度,整合得到经纬度excel表,保存为.csv格式

以黄檗为例,仅显示有照片标本,选取近十年数据,手动录入采集签经纬度信息,转换为十进制格式

【四川*成都】基于MaxEnt生态位模型物种分布预测与高阶个性化分析

1.2 气候数据

在World Clim网站下载世界历史气候数据。

本次选取生物气候变量,分辨率5m,下载压缩包,解压得到19个变量对应的tif文件

19个变量不列了,段尾variables点进去有对应值

1.3 插件下载

给ArcGIS下个SDM toolbox插件

2. 数据导入ArcGIS

研究对象黄檗分布区在中国,故将世界地图沿中国国界线裁剪后转为asc格式

3. 导入MaxEnt 

对比19项变量,进行环境变量性质设置(都是连续型我就不改了)

测试集25%,训练集75%;重复次数设置为10,选取ROC最大的一次作为输出结果

RUN!

结果:

打开提供的网页版,截几张图:

(AUC>0.9,结果较可靠)

分布区

各变量贡献

4.把结果导入GIS

直接导入asc文件结果如图

进行分级:

还可以导个省界线之类分析一下,这里不再赘述

放两张丑丑的(半)成品图

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MaxEnt是一种用于建立概率分布模型的机器学习技术,用于在给定一组约束条件的情况下最大化熵值。MaxEnt v3.4.4是MaxEnt的一个版本,以下是关于MaxEnt v3.4.4的简要教程。 首先,安装MaxEnt v3.4.4软件,并确保您的电脑系统符合软件的要求。 接下来,您需要准备用于训练模型的数据集。数据集应包括输入特征和对应的标签或结果。确保数据集的质量和完整性,以获得准确的模型训练结果。 然后,您可以使用MaxEnt v3.4.4提供的命令行工具或图形界面来训练模型。在命令行工具中,您可以使用类似于“maxent inputfile.txt -m modelname.txt”的命令来指定训练数据和模型名称。在图形界面中,您可以通过可视化的方式来指定训练数据和模型参数,并进行模型训练。 一旦模型训练完成,您可以使用训练好的模型来进行预测或分类。在命令行工具中,您可以使用类似于“maxent inputfile.txt -p modelname.txt”的命令来进行预测。在图形界面中,您可以通过交互式界面来进行预测操作。 最后,您可以评估模型的性能和准确性,以便进行后续的优化和改进。比较模型的预测结果和实际结果,分析模型的误差和准确率,以确定模型的适用性和改进方向。 通过以上步骤,您可以初步了解如何使用MaxEnt v3.4.4进行模型训练和预测,希望这个简要教程对您有所帮助。

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