numpy和VTK互转

最新推荐文章于 2023-09-28 15:53:29 发布
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分类专栏： VTK 文章标签： numpy python 机器学习
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里面的数据形式得是vtkimagedata形式才可以

VTK转numpy

    nshape = tuple(reversed(mergedImage.GetDimensions()))
    label_array = vtk.util.numpy_support.vtk_to_numpy(mergedImage.GetPointData().GetScalars()).reshape(nshape)
    label_array=label_array.astype(np.int8)

numpy转VTK

   pred_label_numpy=np.load("/home/chenxiaohui/project/test/pred_label.npy")
   data_vtk = numpy_support.numpy_to_vtk(pred_label_numpy.ravel(),array_type=vtk.VTK_UNSIGNED_CHAR)
   vimage = vtk.vtkImageData()
   vshape = tuple(reversed(pred_label_numpy.shape))
   vimage.SetDimensions(vshape)
   vimage.GetPointData().SetScalars(data_vtk)
   vimage.SetSpacing(mergedImage.GetSpacing())
   vimage.SetOrigin(mergedImage.GetOrigin())
我的辉
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专栏目录
numpy格式至vtk转换代码
01-13
将np文件格式转换成vtk，带自定义坐标系统
数据篇——numpy array数据转换为VTKImageData
qq_51007998的博客
09-27 658
numpy array是一个离散的三维空间数据场（离散体数据场），格式为三维数组，需把numpy数据转成vtk里可以用的格式：numpy array -> vtkIImageData。这里的1D array得是C order（row-major order），最好使用deep copy（1）以免出现一些内存管理的问题。# 参数二：deep一般设为1（True），采用deep——copy模式，避免内存问题。# 参数一：这里的num_array必须是1维或2维数组，因此一般需用。将3维数组平铺为1维数组。
vtkimage to numpy
強雲的博客
12-09 705
import numpy as np import vtk from vtk.util.numpy_support import vtk_to_numpy image = *.GetOutput() #只要得到的数据类型为vtkimage即可 rows, cols, _ = image.GetDimensions() scalars = image.GetPointData().GetScalars() arr = vtk_to_numpy(scalars) arr = arr.reshape(rows,
numpy转vtk并切片
思维缜密的博客
01-27 3964
#!/usr/bin/env python # _*_ coding:utf-8 _*_ import vtkmodules.all as vtk if __name__ == '__main__': reader = vtk.vtkNIFTIImageReader() reader.SetFileName('img/RibFrac101-image.nii.gz') reader.Update() extent = reader.GetOutput().GetExten
VTK和numpy的整合
weixin_40744368的博客
10-25 3355
翻译和修改自：https://blog.kitware.com/improved-vtk-numpy-integration/ 英文原文作者：Berk Geveci Part1 VTK中有一个名为numpy_interface的Python模块，该模块的主要目的是简化VTK和numpy的接口。 import vtk from vtk.numpy_interface import dataset_a...
Python的Numpy和Vtkimagedata之间的互相转换
weixin_43930603的博客
03-18 3119
曾经做过读取NII格式的数据，然后通过VTK渲染出来的小程序，虽然很简单，但是还是找了一两天的时间~可能我修炼不够吧，哈哈，share…要是对大家有用就好，上码： def numpyarray2vtkimagedata(self,arr): vtk_data = numpy_to_vtk( arr.ravel(), array_type=vtk.VTK_UNSIGNED_CHAR) self.im...
基于 VTK 和 Numpy 的 python 模块，用于科学分析 3D 数据
最新发布
02-27
VTK（Visualization Toolkit）和Numpy是这两个领域的基石，而基于这两者的vedo模块则为科学家和工程师提供了一种强大的工具集，用于分析和展示3D数据。下面将详细介绍这两个库以及vedo模块在3D数据处理中的应用。 ...
基于 VTK 和 Numpy 的 python 模块，用于科学分析3D数据
02-25
基于 VTK 和 Numpy 的 python 模块，用于科学分析3D数据 特征 该库包括大量工作示例，适用于各种功能 1.使用多边形网格和点云 2.使用体积数据和四面体网格 3.2D 和 3D 绘图和直方图 4.与其他库集成
VtkImageData类型数据转为Python中的Numpy.array数据
聆雨。
01-03 1125
VtkImageData --> Numpy.array 代码如下：（vtkimage是VtkImageData类型数据） # 获取图像大小 cols, rows, levels = vtkimage.GetDimensions() # 获取vtkDataArray类型变量 sc = vtkimage.GetPointData().GetScalars() # 转为ndarray类型一维向量 imageArr = vtk.util.numpy_support.vtk_to
Python VTK numpy数据3D可视化
Pandako's Blog
08-23 9536
在Python的3D图像处理中，通常用numpy array来进行非常方便的计算或者转化，这里记录一下numpy数据的VTK可视化基本流程，包括面绘制（Surfase Rendering）和体绘制（Volume Rendering）。除去数据格式转化，面绘制和体绘制在C++中也是类似的处理方法。 numpy数据转成vtkImageData 首先得把numpy数据转成vtk里可以用的格式：numpy array -> vtkIImageData。这里的numpy array是一个离散的三维空间数据场，0
Python从VTK 的 RenderWindow中取出 JPG图像信息变成 numpy格式
comedate的专栏
10-30 718
Python从VTK 的 RenderWindow中取出 JPG图像信息变成 numpy格式 vtkWindowToImageFilter
numpy生成网格方法
xf1234的博客
06-12 1226
nump生成网格矩阵
python meshgrid_numpy的生成网格矩阵 meshgrid()
weixin_39917437的博客
12-09 2068
numpy模块中的meshgrid函数用来生成网格矩阵，最简单的网格矩阵为二维矩阵meshgrid函数可以接受 x1, x2,..., xn 等 n 个一维向量，生成 N-D 矩阵。1 基本语法meshgrid(*xi, **kwargs)参数：xi -x1, x2,..., xn : array_like返回值：X1, X2,..., XN : ndarray2 示例(二维网格)2.1 一个参...
Python可视化：使用VTK绘制基于Numpy数组的图形
CnyhCode的博客
09-19 175
Numpy是一个用于科学计算的强大库，它提供了高性能的多维数组对象和相应的操作函数。我们将使用Numpy数组作为VTK图形的数据源。这只是VTK库的基本用法示例，你可以根据自己的需求进一步探索VTK的功能和特性。使用VTK和Numpy，你可以绘制各种类型的图形，如体绘制、曲面绘制、等值线绘制等。最后，我们创建了一个VTK渲染器和渲染窗口，并将图形对象添加到渲染器中。接下来，我们将VTK数组与VTK数据对象关联，并创建了一个VTK图形对象（现在，我们将使用VTK库来创建一个基于Numpy数组的图形。
【三维几何学习】使用VTK对网格输入特征进行可视化
做减求空
03-07 1072
使用python调用VTK库对网格的输入特征进行可视化，方便后续实验与分析。
VTK：隐式数据集裁剪实例——使用Python实现
code_welike的博客
08-26 230
在计算机图形学中，裁剪（Clipping）是一种常用的操作，它可以将一个复杂的几何体转换为简单的几何体。在 VTK（Visualization Toolkit）中，我们可以使用 vtkClipDataSet 类来裁剪数据集，并生成新的数据集。本文将介绍如何使用 VTK 中的 vtkClipDataSet 类进行数据集裁剪，并给出 Python 代码示例。其中，我们将使用 VTK 中自带的 Implicit Function（隐式函数），即隐式表示的几何对象，来定义裁剪面。接下来，我们需要加载数据集。
python医学图像处理之基于vtk的三维点云表面重建
Cherry330的博客
09-28 898
通过读入坐标值，利用vtk实现三维点云表面重建。
VTK学习笔记（三十三）从vtkPolyData获取点数据
juluwangriyue的博客
04-14 2760
VTK学习笔记（三十三）从vtkPolyData获取点数据 from vtk.util import numpy_support import numpy as np points = vtk.vtkPoints() points.InsertNextPoint(0.0, 0.0, 0.0) points.InsertNextPoint(1.0, 0.0, 0.0) points.InsertNextPoint(2.0, 0.0, 0.0) original = vtk.vtkPolyData() orig
Day 1 - 基本语法
qq_41175455的博客
09-22 1260
Day 1 1.基本语法 一、语句 （1条有效程序） print('你好！') print('世界！') # 一行有多条语句，要用分号隔开 print('你好！');print('世界！') 二、注释 注释是代码中不参与编译执行的说明性文字（不影响程序功能） # 单行注释————Ctrl+/ print('hello world!') # 在控制台打印hello world! # 多行注释————将文字放入一对'''或"""之间 """ 注释1 注释2 注释3 """ ''' A B
numpy_to_vtk
09-29
numpy_to_vtk是一个将NumPy数组转换为VTK数据格式的工具。NumPy是一个Python库，用于处理大型多维数组和矩阵，而VTK是一个用于可视化和处理科学数据的开源软件系统。 通过使用numpy_to_vtk，我们可以将NumPy数组中的数据转换为VTK数据对象。这样，我们就可以在VTK中进行进一步的数据处理、可视化和分析。 在使用numpy_to_vtk之前，我们需要先安装VTK和NumPy库。安装完后，我们可以使用下面的步骤来使用numpy_to_vtk: 1. 首先，导入所需的库： ```python import numpy as np from vtk.numpy_interface import dataset_adapter as dsa ``` 2. 创建一个NumPy数组： ```python numpy_array = np.array([[1, 2, 3], [4, 5, 6], [7, 8, 9]]) ``` 3. 使用numpy_to_vtk将NumPy数组转换为VTK数据对象： ```python vtk_array = dsa.numpyTovtkDataArray(numpy_array) ``` 现在，我们已经将NumPy数组成功转换为VTK数据对象。我们可以使用vtk_array在VTK中进行各种操作，如可视化、数据处理和分析等。 总之，numpy_to_vtk是一个实用的工具，可以将NumPy数组转换为VTK数据格式，使得我们可以在VTK中使用NumPy数组进行进一步的数据处理和可视化。它极大地方便了科学数据的处理和分析工作。
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