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原创 基于Kaggle学习MONAI(三)2D-Segmentation例程代码详解1

MONAI网站提供了2D分类/分割、3D分类/分割等例程代码如下图所示,通过学习例程代码,初学者能够尽快掌握MONAI框架,但是由于开源框架软件版本更新较快、各模块功能难以协调等原因,这些例程往往无法在Kaggle平台直接运行。本文对MONAI官网第二个例程,即2D分割例程的代码在Kaggle平台进行了修改和调试,并对修改后的例程代码进行了详细注释,为大家提供参考。本例程的数据集是由MONAI框架的函数生成随机圆圈图像,非常适合展示面向分割应用模型的训练与评估过程。

2024-05-25 14:11:46 949

原创 基于Kaggle学习MONAI(二)轻松上手 transforms(下)

MONAI的transforms模块提供了功能强大的图像预处理函数,这些函数既可以单独使用,也可以组合在一起使用。本文介绍了LoadImaged,EnsureChannelFirstd,Resized等基本函数的使用方法,大家跟着练习后能够很快掌握这些函数,也能为理解和运用官方提供的其他函数打下良好的基础,因为这些函数的应用模式都是相似的。另外,轻松上手transforms代码文件已上传至资料区,如有需要大家也可以下载比对。

2024-05-23 21:50:44 1061 1

原创 基于Kaggle学习MONAI(二)轻松上手 transforms(上)

transforms是MONAI提供的数据预处理API,可以用来进行数据加载、保存,还可以进行图像旋转、尺度缩放、裁剪等常规图像处理功能。本文详细介绍在Kaggle平台如何实现MONAI transforms的常用操作。今天介绍了MONAI框架transforms所涉及的一些基本操作,包括数据装载LoadImaged、通道优先EnsureChannelFirstd和尺寸缩放Resized,并通过可视化看到了变换后的结果。

2024-05-22 15:31:31 1069

原创 基于Kaggle学习MONAI(一)例程代码详解2

本文在对MONAI例程“Medical Image Classification Tutorial with the MedNIST Dataset”简要总结的基础上,归纳了应用MONAI框架进行医学图像分类的一般步骤。随后,基于Breast Ultrasound Image数据集,逐步介绍如何把MONAI例程快速地应用到新的数据集上,帮助初学者轻松掌握MONAI框架,并尽快地应用到自己研究的专有数据集上。

2024-05-20 15:37:49 1073

原创 基于Kaggle学习MONAI(一)例程代码详解1

通过MONAI提供的Medical Image Classification Tutorial with the MedNIST Dataset例程,我们对MONAI框架用于医学图像分类任务流程有了初步了解。一般来讲,基于MONAI的流程可以分为:数据预处理、数据集划分、模型定义(含算法、损失函数选择)、模型训练验证和模型评估。

2024-05-19 16:44:14 731 1

原创 基于Kaggle学习MONAI(一)

只做了一点小改动,就可以在Kaggle平台运行MONAI的例程,后面将会利用Kaggle的GPU资源深入学习、理解MONAI相关例程,为基于MONAI的医学影像应用开发打好基础。

2024-05-18 13:46:57 615 1

轻松上手 transforms代码

轻松上手 transforms代码

2024-05-23

基于Kaggle学习MONAI(二)轻松上手 transforms测试数据

包含CT图像和掩模图像

2024-05-22

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