R -- 置换检验

All_Will_Be_Fine噻

于 2023-04-11 15:24:06 发布

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分类专栏： R 统计学文章标签： r语言

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brief

如果数据来自理论分布，t检验，u检验当然适用，如果违反了统计假设怎么办，这时候参数检验就不太适用了？
例如，数据抽样于未知或者混合分布，样本量过小，存在离群点等
在这里插入图片描述

置换检验处理上述问题的基本思路：

Coin包做独立性检验

# coin 包对于独立性问题提供了一个非常全面的置换检验框架
install.packages("coin")

# lmPerm包专门用来做方差分析和回归分析的置换检验
# 先下载 http://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/lmPerm
install.packages("F:/迅雷下载/lmPerm_1.1-2.tar.gz", repos=NULL, type="source")
library(coin)
library(lmPerm)

在这里插入图片描述

独立两样本和K样本检验

在这里插入图片描述

# 有什么区别？
?wilcoxsign_test #来自coin包 ，置换检验，对照的是经验分布表
?wilcox.test # 来自stats基础包，可选参数更丰富

方差分析和独立性检验检测物种药物对胆固醇的治疗效果的差异

library(multcomp)
set.seed(1234) # 置换检验时会随机抽样，以及抽样多少次，设定种子可以固定随机数使结果可重现
oneway_test(response~trt, data=cholesterol,distribution=approximate(nresample=9999))
fit <- aov(response~trt, data=cholesterol)
summary(fit)

在这里插入图片描述