蛋白组笔记之-实践4 膜蛋白的分析

最新推荐文章于 2024-04-17 17:11:42 发布
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分类专栏： 四大组学笔记
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一、跨膜蛋白的分析
1.判断蛋白是否是膜蛋白分析软件SOSUI
在这里插入图片描述
结果
在这里插入图片描述
2.TopPred: 分析细胞膜蛋白拓扑结构(可直接将序列粘贴进行分析)
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结果：
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二、膜锚定蛋白的GPI位点分析（GPI能够与糖分子结合）

xingyuan6
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膜蛋白简介
DS00HY的小博客
12-01 4262
“好久没写博客啦，研究生一直在学生物相关知识，而且最近一直在飞书文档记录，突然想搬一点到博客里面来，给大家共享一下，如果有错误，欢迎大家指正。” 膜蛋白membrane Protein 膜蛋白介绍 跨膜蛋白Transmembrane Protein：跨越整个膜具有细胞外区域和胞质内区域的蛋白质。结构一般是以a螺旋形式存在的。疏水性。 分类（与膜的相互作用） 外周膜蛋白（peripheral protein/extrinsic protein）：与整合膜蛋白结合或者插入膜外周区域而暂时结合与膜上的蛋白.
生物化学医学软件
YueR
04-27 8034
一、 三维分子类 1.RASMOL：http://www.openrasmol.org/ Win free 观看生物分子3D微观立体结构的软件,可以旋转,以多个模式观看，并可以存成普通图形文件。RasMol 2.6 中文说明10K RasMol使用的简单中文说明,对RasMol的常用操作做了一个说明。 2.RasTop：http://www.geneinfinity.org/rastop/ ...
蛋白质性质和结构分析
luciazzzz的专栏
08-18 1万+
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图解三代测序（Nanopore）
热门推荐
Baimoc
02-03 3万+
一、测序原理 先介绍 Nanopore 测序中的几位主角： Reader ：在自然界中，有一种可以嵌入到细胞膜中作为离子或分子通道的跨膜蛋白，具有天然的蛋白纳米孔。经过人为基因工程修饰后，得到的就是 Nanopore 测序所需的 Reader 蛋白。 Membrane：Reader 蛋白会被嵌入到高电阻率的 Membrane （人工合成的多聚物膜），膜两侧是离子溶液，在两侧加不同的电位，离子就会在孔中流动，形成电流。 Motor：在 Nanopore 文库构建时，需要在接头上连接一种动力蛋白，用于将DN
生物学软件大汇总！史上最全
qq_43176678的博客
09-30 1万+
基因芯片 1、基因芯片综合分析软件。 ArrayVision 7.0 一种功能强大的商业版基因芯片分析软件，不仅可以进行图像分析，还可以进行数据处理，方便protocol的管理功能强大，商业版正式版：6900美元。 Arraypro 4.0 Media Cybernetics公司的产品，该公司的gelpro, imagepro一直以精确成为同类产品中的佼佼者，相信arraypro也不会差。 pho...
JET毛选学习笔记：如何利用《实践论》学习实验
qq_30452897的博客
04-17 825
JET毛选学习笔记：如何利用《实践论》学习实验
生物信息软件综合实践学习笔记
weixin_73362123的博客
12-04 710
学习资料是现代生物学研究基础，以下是一些学习记录。实验室安全等级划分实验动物福利与伦理概述实验动物： 经人工培育、对其携带的微生物实行控制、遗传学背景明确或来源清楚，用于科学研究、教学、生物制品或药品鉴定及其他科学实验的动物。实验动物福利： 是指人类保障实验动物健康和快乐生存权利的理念及其所提供的相应外部条件的总和。实验动物福利涵盖的因素：SCI介绍1.三大科技文献检索系统SCI：科学引文索引 包括五种索引：引文索引 专利引文索引 来源索引 单位/机构索引 轮排主题索引ISTP：科技会议索引 EI：工程索引
MPB：上海巴斯德所崔杰组-RNA病毒组与生物信息学分析
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
05-18 3346
为进一步提高《微生物组实验手册》稿件质量，本项目新增大众评审环节。文章在通过同行评审后，采用公众号推送方式分享全文，任何人均可在线提交修改意见。公众号格式显示略有问题，建议电脑端点击文末阅...
医学检验知识重点笔记.pdf
10-14
医学检验是一门综合性的学科，涉及到生物化学、微生物学、免疫学等多个领域的知识。...每项检验指标都有其特定的临床意义和应用价值，检验人员需要对这些知识有深入的理解，以便准确地运用到临床实践之中。
论文研究 - 使用生物计算工具鉴定ERK相互作用蛋白并进行理化分析
05-28
ERK（细胞外信号调节激酶）或MAP激酶是细胞内信号分子。 ERK参与各种功能的调节，例如细胞增殖，细胞迁移，细胞存活等等。 它可以响应各种刺激（例如生长因子，细胞因子，病毒，第二信使，转化剂和致癌物）而被激活。 在将信号从细胞表面受体传递到细胞核时，ERK与许多蛋白质相互作用。 这些蛋白质的理化和功能表征鲜为人知。 因此，我们尝试使用生物计算工具研究ERK相互作用蛋白的物理化学和功能特性。 ExPASy和SOSUI服务器建议使用22种ERK相互作用蛋白。 这些ERK相互作用伙伴的物理和化学参数表明，较高比例的疏水性氨基酸和亮氨酸为主要成分。 此外，不稳定性指数表明四种蛋白在体外宽温度范围内均稳定，而发现其余十八种蛋白不稳定。 此外，SOSUI服务器显示，自然界中有15种蛋白质是可溶的，有6种是跨膜的。
执业兽医资格考试笔记(整理好).doc
11-26
4. 细胞器包括线粒体（负责氧化磷酸化）、核蛋白体（合成蛋白质）、内质网、高尔基体（与分泌和糖类合成有关）、溶酶体（细胞内的消化器）、中心体（与细胞分裂相关）、微丝、微管和中心丝（构成细胞骨架）以及过...
江南大学-食品学院-803微生物-真题2016-2020.docx
09-15
以上是对给定文件中知识点的详细解析，这些知识点涵盖了微生物学的基础理论以及应用实践，对于准备研究生入学考试的学生来说是非常重要的复习材料。通过深入理解这些概念和原理，可以帮助考生更好地掌握微生物学的...
简单易记的执业医师考试资料：生理笔记.pdf
11-18
《生理笔记》是针对执业医师考试的一份复习资料，涵盖了细胞基本功能、血液以及血液循环等多个重要生理学主题。以下是对这些知识点的详细解释： 1. **细胞的基本功能**： - **单纯扩散**：脂溶性小分子通过细胞膜...
"基因工程技术：基因改造和质粒分离的实践指南
在这个过程中，常用的方法包括使用溶菌酶破坏菌体细胞壁，以及使用SDS和Triton X-100来使细胞膜裂解，以释放质粒DNA。 染色体DNA通常用于构建基因组文库和Southern杂交等实验。基因组DNA的提取是为了从生物体中得到...
韦恩图的制作
jingshuanghuakai的博客
07-20 5917
1.在基因组和蛋白组或者其它的实验经常会需要比较每个组差异基因或者差异蛋白之间否具有交集、并集等，这样的情况往往会使用韦恩图来制作。 1.1韦恩图可以利用在线工具来制作，网址为https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html 1.2可以将每组序列分别粘贴到list里 2.如果想要看交集都有那些元素 可以 ...
蛋白组笔记之-实践2 人溶菌酶蛋白二级结构的分析
jingshuanghuakai的博客
02-17 1516
1.二级结构的分析prabi网址 2.可直接粘贴序列进行分析 3.分析结果
蛋白组笔记之-实践3 人溶菌酶蛋白三级结构的分析
jingshuanghuakai的博客
02-17 512
1.人溶菌酶蛋白三级结构的分析（可直接粘贴序列进行分析）swissmodel 2.结果的分析
pre-push commit规范检查
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深入探索C++ STL与泛型编程：侯捷笔记1-4讲
STL（Standard Template Library，标准模板库）是C++中的一个核心组件，它是泛型编程的最佳实践之一。通过分析STL的源代码，学习者可以深入理解如何构建高效、灵活的代码。笔记中提到了使用STL的不同层次：从基础...
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