膜蛋白简介

本文介绍了膜蛋白的基础知识,包括膜蛋白的分类、结构特点,重点探讨了跨膜蛋白的a螺旋形式、二级结构预测方法以及分子动力学研究。同时提到了相关数据库和预测工具,如TMbase、OPM等,对于理解膜蛋白在生物膜中的角色及其功能具有指导意义。

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“好久没写博客啦,研究生一直在学生物相关知识,而且最近一直在飞书文档记录,突然想搬一点到博客里面来,给大家共享一下,如果有错误,欢迎大家指正。”

膜蛋白membrane Protein

膜蛋白介绍

  • 跨膜蛋白Transmembrane Protein:跨越整个膜具有细胞外区域和胞质内区域的蛋白质。结构一般是以a螺旋形式存在的。疏水性。
  • 分类(与膜的相互作用)
    • 外周膜蛋白(peripheral protein/extrinsic protein):与整合膜蛋白结合或者插入膜外周区域而暂时结合与膜上的蛋白质。通过疏水、静电、非工具相互作用实现可逆结合。
      • A 蛋白质与磷脂双层的胞质表面离子相互作用附着,(AB只是锚定膜的一侧,结构类似膜内蛋白)
      • B翻译后添加碳氢链附着(无特定结构或序列特征)
    • 整合膜蛋白(Integral membrane protein):与膜结合性很强,以B或a折叠镶嵌在膜内为环状脂质分子围绕。
      • C一部分嵌入在脂双层中,穿膜一次
      • D多次穿膜
    • 脂锚定蛋白:是膜蛋白以共价键与脂相连,并以脂肪酸链插入膜中,细胞外表面和胞质面都存在
  • 疏水属性量化:
    • 疏水性尺度(hydrophobic-scale):给每个氨基酸疏水性进行赋值
      • 计算: 测量水溶剂转移到模拟膜环境的
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