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RSS订阅原创 RNA-seq数据分析——质量控制和预处理的软件
质量问题通常来源于测序本身或前面的文库制备。它们包括可信度低的碱基、序列特异性差的偏差、3’/5’位置偏差、聚合酶链反应（PCR）假象、未修剪的接头，以及序列污染。这些问题可能严重影响参考作图、组装及表达的估计，但这些问题很多可以通过过滤、修剪、纠错或偏差订正被矫正。有些问题不能被纠正，但在解释结果时至少应该意识到它们。读段的质量检查工具包括 FastQC 和 PRINSEQ，它们检查若干个质量指标，并提供可视化的报告。PRINSEQ软件包还提供过滤和修剪功能。FastQCFastQC可以
2022-05-02 15:51:57
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原创 下载R包遇到的问题用这个方法解决了！！！
之前我一直以为一个镜像源能适用于下载所有的R包，然而最近两天在线下载R包没有一次成功的，也改了很多次镜像源，然而每次都报错：unable to access index for repository http://streaming.stat.iastate.edu/CRAN/src/contrib: cannot open URL ‘http://streaming.stat.iastate.edu/CRAN/src/contrib/PACKAGES’直到我看到了这篇文章：https://www.j
2021-08-22 21:36:57
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原创 在win 10下用Rstudio安装maftools报错compilation failed for package ‘maftools‘
install.packages("E:/R/R-4.1.1/library/maftools_2.8.0.tar.gz", repos = NULL, type = "source")运行过程如下：* installing *source* package 'maftools' ...** using staged installation** libs*** arch - i386"E:/R/rtools40/mingw32/bin/"gcc -I"E:/R/R-41~1.1/incl
2021-08-21 16:27:00
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原创 在Rstudio安装RCurl报错—fatal error: curl/curl.h: No such file or directory
# R version 4.1.1 (2021-08-10)install.packages("E:/R/R-4.1.1/library/RCurl_1.98-1.4.tar.gz", repos = NULL, type = "source")* installing *source* package 'RCurl' ...** package 'RCurl' successfully unpacked and MD5 sums checked** using staged installati
2021-08-21 16:25:08
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原创 【学习笔记】R数据科学（R for Data Science）—第3章 使用dplyr进行数据转换
【学习笔记】R数据科学（R for Data Science）—第3章 使用dplyr进行数据转换
2021-08-17 22:18:26
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原创 【学习笔记】R数据科学（R for Data Science）—第2章 工作流：基础
【学习笔记】R数据科学（R for Data Science）—第2章 工作流：基础练习题
2021-08-17 00:45:19
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原创 【学习笔记】R数据科学（R for Data Science）—第1章 使用ggplot2进行数据可视化
【学习笔记】R数据科学（R for Data Science）—第1章使用ggplot2进行数据可视化
2021-08-17 00:36:57
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原创 GO基本知识
GO的全称是Gene Ontology，中文意思是基因本体论。GO是一个国际标准化的基因功能分类体系，提供了一套动态并可控的词汇表来全面描述生物体中基因和基因产物的属性，它由一组预先定义好的GO术语（GO term）组成，这组术语对基因产物的功能进行限定和描述。GO terms是对基因的产物而不是基因本身进行描述，因为基因的产物有时候不止一种。GO知识库GO terms提供生物过程的逻辑...
2020-06-13 11:21:57
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原创 MySQL不支持intersect？
select * from cop.student where sdept='CS' intersect select * from cop.student where sage<=19 /*查询计算机科学系的学生与年龄不大于19岁的学生的交集*/select sno from cop.sc where cno='1' INTERSECT select sno from cop.sc where cno='2'; /*查询选修课程1的学生集合与选修课程2的学生集合的交集*/打完代码就发现代码
2020-06-10 09:01:29
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原创 MySQL代码运行返回异常的情况
暂时还不知道没有返回的原因，做个笔记1.不明白为什么第一种情况的代码没有返回而第二个有select cop.student.*, cop.sc.* from cop.student, cop.sc where student.sno=sc.sno; /*查询每个学生及其选修课程的情况*/ /*等值连接'='*/ select student.sno, sname, sex, sage, sdept, cno, grade from cop.student, cop.sc; #where s
2020-05-27 15:42:13
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原创 Rstudio安装R包错误
**R包安装错误： 无法打开 URL’https://cran.rstudio.com/src/contrib/PACKAGES’解决办法：win10：控制面板>internet选项>高级>安全，勾选使用TLS.1.1和使用TLS1.2
2020-05-19 14:15:57
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原创 Windows安装MySQL
我是按照这个网址的步骤安装的。（https://www.runoob.com/w3cnote/windows10-mysql-installer.html）安装时遇到了一些问题，卸载重新装了几次才成功，我太菜了。。1.这里试了好几次都匹配不上后来重装的时候跳过勾选Bootstrap MySQL Router for use with InnnoDB cluster就可以了。路径配置之后...
2020-04-12 13:56:28
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转载 生物学软件大汇总！史上最全
基因芯片1、基因芯片综合分析软件。ArrayVision 7.0 一种功能强大的商业版基因芯片分析软件，不仅可以进行图像分析，还可以进行数据处理，方便protocol的管理功能强大，商业版正式版：6900美元。Arraypro 4.0 Media Cybernetics公司的产品，该公司的gelpro, imagepro一直以精确成为同类产品中的佼佼者，相信arraypro也不会差。pho...
2019-09-30 18:21:51
15203
原创 生信相关网站
http://www.xiaolvji.com/u/bioinfoclub?tdsourcetag=s_pcqq_aiomsg网页来自https://www.jianshu.com/p/7a8da453c9e6
2019-08-23 16:39:16
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