Slicer学习笔记(十五)分割图像

本文记录了使用Slicer进行医学图像分割的详细步骤:从导入图像到使用Segment Editor模块,通过Paint工具绘制前景和背景,设置分割,进行修改,最后应用设置并生成3D结果。教程适合想要学习Slicer图像分割的初学者。
摘要由CSDN通过智能技术生成

在网上没有找到很详细的医学图像分割教程,就笔记一下。

1、打开slicer,导入图像。

直接拖进slicer就可以实现nrrd格式的图像加载。

2、从modules那里选择Segment Editor

在Add那里点2下,第一个名字默认为 Segment_1,第二个默认为 Segment_2,此处我重命名为bg,即bg代表背景。
在这里插入图片描述

3、主要使用Paint 绘制前景和背景

在这里插入图片描述

4、设置分割

选择“Grow from seeds”,然后选择下方的“Initialize”。注意选择Initialize后,会

Python是一门高级编程语言,它是一种动态类型、面向对象的语言,支持多种编程范式。Python在科学计算、数据分析、人工智能等领域有广泛的应用,越来越受到业界的关注。Python还有一个优点就是其灵活的扩展性,可以通过编写扩展模块来增强Python的功能。 编写一个Python扩展模块,需要先了解一下Python的C API,这是Python提供的一套C语言的API接口,可以用于编写Python扩展模块或者嵌入Python到其他应用程序中。扩展模块也可以用其他语言如C++、FORTRAN等编写,只要是遵循Python的C API规范即可。 编写Python扩展模块,可以使用Python自带的distutils模块来进行构建和安装。该模块可以用setup.py脚本来配置扩展模块的编译参数、依赖库等,并可以生成可执行文件或者扩展模块所需的动态链接库等文件。 下面是一个简单的Python扩展模块的例子,该模块可以计算两个数字的乘积: // test_module.c #include <Python.h> static PyObject* multiply(PyObject* self, PyObject* args) { int x, y; if (!PyArg_ParseTuple(args, "ii", &x, &y)) { return NULL; } return Py_BuildValue("i", x * y); } static PyMethodDef TestModuleMethods[] = { {"multiply", multiply, METH_VARARGS, "Returns the product of two integers."}, {NULL, NULL, 0, NULL} }; static struct PyModuleDef test_module = { PyModuleDef_HEAD_INIT, "test_module", "A test module that multiplies two integers", -1, TestModuleMethods }; PyMODINIT_FUNC PyInit_test_module(void) { return PyModule_Create(&test_module); } 在该模块中,我们定义了一个multiply函数,用于计算两个整数的乘积。该函数采用Python提供的PyArg_ParseTuple函数解析函数的输入参数,然后返回乘积。我们还定义了一个TestModuleMethods数组,它是一个PyMethodDef结构体的数组,里面记录了我们定义的函数的名称、函数指针、函数的参数类型等信息。最后我们使用PyModule_Create函数生成一个Python模块对象并返回。 我们需要将上面的代码保存到test_module.c文件中,并使用如下命令来构建并安装该模块: $ python setup.py build $ python setup.py install 在安装完成后,我们可以在Python解释器中使用该模块: >>> import test_module >>> test_module.multiply(10, 20) 200 编写Python扩展模块是一项有趣的工作,它可以让我们深入了解Python的内部机制,并且可以为我们解决一些实际问题带来便利。
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