R包survival拟合cox模型模型出现“Error in `[.default`(y, , 3) : 下标出界”的错误

作者在使用R的cph函数进行Cox回归时遇到错误,发现问题源于因变量心血管为字符类型。cph要求结局变量为数值,将字符变量转换为数值并指定参照组后,模型得以正确拟合。这是一次关于变量类型对R模型影响的实用经验分享。
摘要由CSDN通过智能技术生成

今天利用R拟合Cox回归模型时候,意外发现模型出错?

下面是我的代码:

fit<-cph(Surv(生存时间,心血管) ~ rcs(bmi,3)+地区+sex+age,data=mydata)

因为我做的是限制性立方样条,所以有rcs。下面是我出错的情况。

经过分析后发现,原因是我的因变量 “心血管”为字符变量导致出错。

这是因为我在前面用如下代码,为 心血管(它的值是1和0)设置了参照组

##设定因子

mydata$心血管<-as.factor(mydata$心血管)

##设置分类变量的参照组

mydata$心血管<-relevel(mydata$心血管, ref="0")

当我删除上面的代码,并重新导入数据,心血管为数值变量时,模型运行成功了。

总结:经过对比,我发现cph拟合模型时,要求结局变量在数据库中必须是数值变量,否则会出错

希望我的经验可以帮助到大家。

  • 6
    点赞
  • 4
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 打赏
    打赏
  • 0
    评论
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包

打赏作者

kaiming0000

你的鼓励将是我创作的最大动力

¥1 ¥2 ¥4 ¥6 ¥10 ¥20
扫码支付:¥1
获取中
扫码支付

您的余额不足,请更换扫码支付或充值

打赏作者

实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值