通用医学图像分割大模型

MedSAM本地部署：

• 项目介绍：该工具可用于分割医学图像中的内容。项目地址：GitHub - bowang-lab/MedSAM: Segment Anything in Medical Images
• 本机项目环境，工具及电脑配置：python3.10，cuda12.4，torch2.2.0，annconda3

• 本地部署

打开Anaconda prompt

1. 虚拟环境创建：conda create -n medsam python=3.10 -y

1. 激活虚拟环境：conda activate medsam

1. 进入项目所在文件夹，如：

D:

D:\liu\Project\MedSAM-main(进入上述网址将项目下载到本地)

1. 安装对应版本的pytorch：pip install torch==2.2.0 torchvision==0.17.0 torchaudio==2.2.0 --index-url https://download.pytorch.org/whl/cu121（不可使用镜像加速，否则安装cpu版本）

1. 使用项目的安装模块进行依赖安装：（pip install -e .）

可以加上-i http://mirrors.aliyun.com/pypi/simple --trusted-host mirrors.aliyun.com 使用阿里源加速

1. 进入MedSAM - Google Drive 将模型下载解压缩至项目中的（work_dir\MedSAM）路径中

1. 在anaconda终端输入命令运行工具：python MedSAM_Inference.py

命令行参数增加：

-i input_img #输入图像

-o output path #输出路径

--box bounding box of the segmentation target #需分割区域

也可直接修改MedSAM_Inference.py文件中的默认参数

坐标与对应参数如图所示（所需参数为左下坐标与右上坐标）