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生信学习
文章平均质量分 53
懒惰的阿呆
这个作者很懒,什么都没留下…
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pheatmap画热图初试
首先,设置工作路径:setwd()getwd()读取基因表达矩阵,例如RSEM输出的matrix文件data<- read.table("./file", header = T, row.names = 1, sep="\t")data2<- data[ 1:100, ]pheatmap(data2)注意:一定要把header = T和row.names = 1参数加上这时的图可能会很丑,例如:原因是没有进行数据标准化,需要加上scale参数,但scale不允许数据中有全原创 2022-02-11 20:49:11 · 207 阅读 · 0 评论 -
windows11中的ubuntu安装BOOST库时,报错Toolset ‘gcc‘ does not appear to support C++11.
安装BOOST库遇到问题原创 2022-01-19 23:15:00 · 2243 阅读 · 3 评论 -
GWAS中常用格式“ped/map”和“tped/tfam”
GWAS需用文件格式ped/map和tped/tfam介绍原创 2022-01-19 18:36:48 · 3291 阅读 · 0 评论 -
安装依赖库神器
安装依赖库万能神器原创 2021-11-24 16:56:37 · 707 阅读 · 0 评论 -
基因差异表达分析——基于RSEM对比,DESeq2操作实例
使用DESeq2的两点要求:DEseq2要求输入数据是由整数组成的矩阵。DESeq2要求矩阵是没有标准化的。下面是基本流程:一、准备工作:确定工作路径,以确保上传文件时无误getwd() #显示当前工作目录setwd() #设置工作目录操作实例:> getwd()[1] "C:/Users/Larkin/Documents"> setwd("C:/Use...原创 2020-02-18 22:30:46 · 11562 阅读 · 5 评论