pheatmap画热图初试

最新推荐文章于 2024-03-27 18:16:35 发布

懒惰的阿呆

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分类专栏：生信学习文章标签：生物信息学

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首先，设置工作路径：

setwd()
getwd()

读取基因表达矩阵，例如RSEM输出的matrix文件

data<- read.table("./file", header = T, row.names = 1, sep="\t")
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pheatmap画热图初试

首先，设置工作路径：setwd()getwd()读取基因表达矩阵，例如RSEM输出的matrix文件data<- read.table("./file", header = T, row.names = 1, sep="\t")data2<- data[ 1:100, ]pheatmap(data2)注意：一定要把header = T和row.names = 1参数加上这时的图可能会很丑，例如：原因是没有进行数据标准化，需要加上scale参数，但scale不允许数据中有全
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