对血液中游离DNA(circulating cell-free DNA, cfDNA)进行分析,从而在临床上用于肿瘤诊断、预后判断及用药指导等各方面的应用,已经展现出巨大的前景。但是由于血脑屏障的存在,对于脑部肿瘤患者,很少有报道在其血液中检测到特定的游离循环肿瘤DNA。
目前对于脑部肿瘤的检测主要分为:
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具有创伤风险的颅内组织活检
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低风险的核磁共振成像
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脑脊液的细胞学检查
后两种方法都不能提供肿瘤组织基因组水平变化的信息
由于脑脊液(cerebral spinal fluid, CSF)在中枢神经系统内和病灶存在充分的接触,其中含有循环肿瘤细胞及循环肿瘤DNA。因此对脑脊液中的ctDNA检测也属于“液态活检”的范畴,可以对脑部肿瘤的原发灶及转移灶进行基因组水平的分析。
本期介绍斯坦福大学Stephen Quake教授实验室进行的工作,即通过ddPCR和NGS方法对脑脊液中的ctDNA进行分析。