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原创 生信技能57 - Samtools获取指定外显子区域depth和提取BAM文件序列
Samtools获取指定外显子区域depth和提取BAM文件序列
2024-08-24 07:00:00
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原创 生信分析进阶8 - 提取hg19/hg38参考基因组着丝粒和端粒区域(灰区)bed
对hg19/hg38参考基因组着丝粒区域、端粒区域、微卫星重复区域和异常比对区域等进行统计,输出bed文件
2024-08-21 10:22:36
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原创 生信技能53 - WisecondorX自动化批量npz转换和reference构建
wiseconrdoX分析CNV适用于CNVseq、NIPT和WGS等项目。
2024-07-26 15:58:43
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原创 生信软件28 - fastq与bam的reads数量计算与双端fastq配对检测工具fastq-pair
fastq与bam的reads数量计算与双端fastq配对检测工具fastq-pair
2024-07-24 09:55:43
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原创 生信软件26 - BWA-MEM比对算法性能更好的bwa-mem2
bwa-mem算法的下一个版本, 英特尔并行计算实验室的Vasimuddin Md和Sanchit Misra开发完成的,相比于bwa-mem速度快1.3-3.1倍。
2024-07-13 19:58:46
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原创 生信软件25 - 三代测序数据灵敏比对工具ngmlr
将PacBio或Oxford Nanopore灵敏地与(大)参考基因组(比如人类参考基因组)对齐
2024-07-11 15:45:27
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原创 生信技能52 - VCF文件hg38与hg19坐标相互转换
对SNP/INDEEL Calling获得的VCF文件进行hg38与hg19的坐标相互转换
2024-07-11 13:16:10
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原创 三代测序结构变异分析 - 单样本Germline SV calling和多样本SV Calling
三代测序单样本Germline SV calling和多样本SV Calling
2024-07-10 15:53:19
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原创 生信技能51 - 基于BAM文件的微生物污染分析流程
提取未比对到人类参考基因组的bam文件,将其比对到微生物参考基因组,根据比对情况查看是否存在污染
2024-07-09 19:52:31
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原创 生信软件24 - 查询物种分类学信息和下载基因组TaxonKit和ncbi-genome-download
查询物种分类学信息和下载基因组TaxonKit和ncbi-genome-download
2024-07-02 10:21:49
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已知人类血红蛋白变异数据库(HbVar)的地贫结构变异(SV)缺失类型区域
2024-08-19
人类参考基因组hg19和GRCh38测序盲区坐标文件
2024-07-12
SNP指纹图谱软件SNPT ,通过高通量测序获得的SNP,用最少的SNP数据区分尽量多的样品
2024-05-17
人群CNV、单倍剂量不足基因DDG2P数据库文件
2024-05-15
NC-012920.1线粒体基因组序列及其BWA参考序列索引
2024-05-15
单细胞RNA测序(scRNA-seq)cellranger count的细胞定量和aggr整合.md
2024-05-12
GenomeAnalysisTK(GATK3.8.0)便携版,无需编译直接使用
2024-04-29
2023年基于二代测序辅助生殖技术专题市场调研报告
2023-12-11
CNV检测工具cnvpytor脚本程序和结果合并python程序,cnvpytor.zip
2023-12-10
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