生信技能68 - bcftools annotate注释VCF SNP的RSID编号

使用 bcftools annotate命令将 dbSNP 数据库中的 RSID 信息添加到你的 VCF 文件中。如果 input.vcf 中的某个变异位点在 dbsnp.vcf.gz 中有对应的 RSID，那么该位点将被标记上 RSID；如果没有对应，则该位点可能不会被标记或者标记为 .（表示无）。

bcftools annotate：

1. dbsnp文件下载

# 下载 dbSNP 数据库文件（示例，需要根据实际情况修改版本和物种）
wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/snp/latest_release/VCF/GCF_000001405.38.gz -O dbsnp.vcf.gz

# 使用 bcftools anno