【3D Slicer】的小白入门使用指南五

已于 2025-01-09 15:32:25 修改
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分类专栏： 医疗影像 文章标签： 医疗影像 人工智能 3D Slicer Segmentator 3D打印
于 2024-11-13 14:20:18 首次发布
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版权

用于3D打印的分割

本教程演示了在Slicer的新分割编辑器模块中进行分割，以3D打印为目的。

国家医学影像计算联盟 http://www.na-mic.org

 作用

举例：创建的脊柱模型的临床应用

  • 用于针刺训练的模型
  • 电磁标记持有器
  • 填充凝胶（类似软组织）
  • 覆盖有片材（类似皮肤）
  • 中心
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【3D Slicer】的小白入门使用指南一
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上一章下载3d slicer的软件,这章从加载数据集来弄清楚3dslicer怎么使用.如果没有数据集,也可用用样本数据.可以添加图片文件夹,(试了MP4不行,内镜的视频估计不支持),添加单个图片的话,会出现一些选项,‌ 这种图通常用于医学图像处理中，表示解剖结构、病变和其他对象的空间位置。图像分割是制作标签图的过程，可以通过手动、半自动或全自动的方法进行‌1。在3D Slicer中，标签图可以用于多种用途，包括可视化某些结构、进行定量分析（如测量体积、表面、形状属性）、3D打印和遮罩处理等。
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刚接手软件的时候，我一直想用自动分割工具，试验了Med sam，依赖安装不了；试验了英伟达的AI，NvidiaAIAssis，传服务器根本没反应，所有只有用了手动切割。不要求所有层面勾画，但是最好是典型层面都勾画一下，特别是有毗邻脏器密度相近的层面。点击3D后可能三维窗口未显示，可以调整一下窗口大小，有可能显示在我们看见的范围之外。早就准备更新这篇了，由于懒癌发作，一直早葛优躺，今天刚好有点时间，就简单写下来。
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EditUI 是编辑Ui的Edit 是 编辑代码的点击Edit UI就可以进入UI编辑界面点击Edit 进入代码编辑界面可以看到下面的代码import osimport vtk# demo11"""""")""")# demo111# demo112"""""""""# Buttons""""""else:""""""""""""""""""其中需要注意的是setup()与Logic类。前者是编写界面的代码，后者是逻辑实现的代码。
【3D Slicer】的小白入门使用指南九
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【3D Slicer】的小白入门使用指南二
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1) 在上面第七步的的基础上，在模块搜索的菜单栏处，将volumes修改为Volume Rendering，得到，并看到左侧有该影像的Display模块信息。4）在Display模块下的Crop处，勾选上Enable和Display ROI，可以得到如下所示的不同的感兴趣区域框。5） 再次勾选上volume处的眼睛图标，同时拖拽3D影像图上的ROI区域框，可以拖出右侧的肾脏，得到2个肾脏图。6）点击右侧红色区域上的钉子图标，并点击链接图标（将三个图链接起来），继续点击眼睛，得到3D影像图。
【3D Slicer】的小白入门使用指南十
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分割编辑器模块提供构建肿瘤区域3D模型的工具SlicerDMRI解决方案使得在周边区域进行白质纤维的3D交互式重建成为可能。
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该步骤可以在apply之后观看三维视图，阈值不合适可以再次调整至合适为止）在三个视图中分别圈出心包的位置（注意多圈一些以免血管可能漏，鼠标右键退出圈点功能）如下图所示，可以在三维视图中对圈的范围进行调整。解决方法1：在标注之前先remove掉三维图像中的小噪点，显卡计算量减小，卡顿减轻。点击此按钮调整图像对比度（关闭标签1视图，鼠标左键上下滑动调整至合适对比度即可）在三维视图中拖拉球刷对冠脉进行标注（shift+鼠标滚轮调整球刷大小）通过三维图像观察冠脉断点，在二维图像中进行补全。
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1.打开3D Slicer，点击Welcome to Slicer-->Developer Tools-->Extension Wizard. 2.点击Create Extension 3.创建插件的名字以及选择插件的存放位置，点击OK之后会在我们的存放位置路径下自动成一个以插件名字命名的文件夹。例如我的插件名字是MyExtension,存放位置是D:\SlicerDemo，点击OK之后，我们就会在D:\SlicerDemo路径下创建一个MyExtension命名的文件夹，具体表现.
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窗宽窗位
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转自“CT诊断学”中的窗宽窗位部分。窗宽与窗位 CT能识别人体内2000个不同灰阶的密度差别。而人的眼睛却只能分辨16 个灰阶度。因此，人眼在CT图像上能分辨的CT值应为125 Hu ( 2000 / 16 ）。换句话说，人体内不同组织CT 值只有相差125Hu 以上，才能为人眼所识别。人体软组织CT值多变化在20 - 50 Hu之间，人眼就无法识别。为此，必须进行分段观察，才能使
3d slicer matlab,使用3D Slicer进行颅骨去除
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3D Slicer是一个免费开源的医学图像处理软件，可以用于医学图像的可视化、分析和处理。其中的“Model Maker”模块可以用于进行三维模型的创建和编辑，包括颅骨去除等操作。 以下是使用3D Slicer进行颅骨去除的步骤： 1. 导入头部CT或MRI图像数据。 2. 在左侧菜单栏中选择Model Maker模块，并新建一个模型。 3. 在新建模型属性设置中，选择“Isotropic spacing”选项，使得图像数据在x、y、z方向上的像素间距相等。 4. 进入“Segment Editor”模块，选择“Segmentation”选项卡，在“Add”中选择“Threshold”进行阈值分割，将颅骨进行分割。 5. 进入“Model Maker”模块，选择“Add Segmentation”添加分割结果，点击“Create Model”生成三维模型。 6. 在三维模型的编辑界面中，选择“Scissors”工具，对颅骨进行切除。 7. 完成颅骨去除后，选择“Export”将结果导出为STL等格式。 以上是使用3D Slicer进行颅骨去除的基本步骤，具体操作可以参考软件官方文档或者相关教程。而MATLAB也可以用于医学图像处理，可以尝试使用MATLAB中的Image Processing Toolbox等工具进行颅骨去除等操作。
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