R聚类算法-层次聚类算法

层次聚类（Hierarchical Clustering算法）

层次聚类算法又称为树聚类算法，它根据数据之间的距离，透过一种层次架构方式，反复将数据进行聚合，创建一个层次以分解给定的数据集。
常用于一维数据的自动分组

层次聚类方法
hclust(dist)

• dist 样本的距离矩阵

距离矩阵的计算方式
dist(data)

• data 样本数据

层次聚类的代码实现：

pColumns <- c('Sepal.Length', 'Sepal.Width', 'Petal.Length', 'Petal.Width');

data <- iris[ , pColumns]

data.e <- dist(data)

data.m <- as.matrix(data.e)

model <- hclust(data.e)

plot(model)

result <- cutree(model, k=3)

table(iris[, 5], result)
 result
              1  2  3
  setosa     50  0  0
  versicolor  0 23 27
  virginica   0 49  1

我们可以看到，层次聚类对这份数据的聚类得到的结果并不是太好！