科研图像处理必备ImageJ初步：直方图和三维强度图

最新推荐文章于 2023-12-29 08:30:00 发布

微小冷

最新推荐文章于 2023-12-29 08:30:00 发布

阅读量4.7k

点赞数 27

分类专栏：软件入门文章标签：图像处理人工智能 imageJ 直方图强度图三维图

本文链接：https://blog.csdn.net/m0_37816922/article/details/135009453

版权

43 篇文章

订阅专栏

ImageJ是NIH开发的开源图像处理软件，功能强大，堪称科研图像处理领域的瑞士军刀。一旦接受了这个设定，那么ImageJ其实是个刀壳，里面内置了无数的小工具，为了尽可能发挥出军刀的威力，自然推荐下载满血版的Fiji，下载之后直接解压就能用了。

如果还在持观望态度，那么也没关系，毕竟是网络时代，ImageJ提供了网页版：ImageJ网页版；如果感觉速度跟不上来，还有国内镜像：ImageJ网页版镜像

安装完成后，可打开一张图像，以lena图为例。图像窗口的左上角会实时显示图像最基本的信息：宽 $\times$ 高，图像类型以及文件的字节数。点击菜单栏Image->Show Info…，或按下快捷键CtrlI，可查看更详细的图像信息。

由于ImageJ并没有一个父窗口，而是每使用要给功能便会新开一个窗口，如果期间又去弄别的软件，可能会忘了都做了啥。这时候可以点击菜单栏Window->Show All，那么所有的窗口就会一同显示出来。

通过快捷键Ctrl+H，或点击菜单栏Analyze->Histogram，可查看图像的灰度分布直方图。点击Live，然后点击RGB，可调整直方图类型，效果如下

在这里插入图片描述

此外，在live模式下，通过工具栏的框选工具对图像中感兴趣的区域进行框选，那么直方图也会随之发生变化。

对于RGB图像而言，也可以一步到位，点击Analyze下的Color Histogram，可以一次出三个图，分别表示三个通道的直方图。

点击菜单栏Analyze->3D Surface Plot，可查看图像的强度分布图。

将RGB图像转换为灰度后，可查看其强度分布图，打开之后，默认是点模式，即左侧的图像，对于RGB图像而言，其Z值为RGB转换为灰度之后的强度。光看左图当然十分诡异，但若将其显示模式从Docts改为Mesh，然后调整视图方向，就可以得到右图，这就能看出是Lena图了。

在这里插入图片描述

这个三维强度工具，还提供了平滑度的选项，在三维视图下，调整其平滑度，可以更加直观地查看算法对像素的影响。唯一美中不足是，当窗口尺寸出现变化时，其纵向尺寸无法恢复，不知道是不是我自己电脑的原因。如果遇到了这种问题，需要删除imagej的缓存文件来重新初始化。