R语言学习3.2

本文介绍了R语言中常用的语言包,如ggplot2、lattice、dplyr等,涉及数据可视化、统计分析、数据整理和生物信息学等领域。ggplot2擅长制作美观的图表,lattice适合新手,gridExtra能合并图表。统计分析推荐forecast和spatstat,数据整理推荐dplyr。在生物信息学方面,Bioconductor是基因分析的好帮手。此外,还提到了knitr和shiny用于数据展示,以及stringr在字符串处理中的应用。
摘要由CSDN通过智能技术生成

DuangDuangDuangDuang

今天上午见了韩先生,心情很帅气٩(๑>◡<๑)۶

R语言最常用的语言包:
下载语言包现在掌握了两种,更喜欢在编辑栏里输入install.packages(),需要用程序包之前要调用它library()然后运行就可以使用里面的函数liao。!!!R语言区分大小写。

数据可视化

ggplot2最常用的作图工具,作图美观漂亮,更能涵盖很多复杂的信息。
lattice与ggplot2可以相提并论,虽然ggplot2作图漂亮但入门比较难,lattice更适合新手使用,作图速度比较快可以制作3维图。
gridExtra可以把几张图合并在一张图里制作,而ggplot2不具备这个功能。

统计分析

forecast 适合分析时间序列数据
spatstat 适合空间分析,eg某病毒发病率在地理空间上的分布特征等
zoo 在forecast中有很多好用的内置函数但有时候需要更简单易行的计算移动平均、移动标准差的函数,now zoo就是一个非常好的补充。
lme4 或 nlme 如果需要做一些复杂的数据,实验分了好几个层,有好多亚组,亚组下面还有亚亚组,eg要做好几种细胞,检测好几个指标每个指标有不同的观察时间点…可以用这两个包其中之一即可将复杂的数据轻松的组织起来。(在药物临床实验中,一般一个临床试验都会有个最主要的研究目标,围绕这个中心问题会收集很多资料,利用其中资料也能得出一些有意义的结论,但不是主要的研究目标,这些次要研究称为亚组研究,其涉及的资料称为亚组。)

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