毕业论文知识点记录（四）——MaxEnt模型

毕业论文知识点记录（四）——MaxEnt模型

0 序言

经过了几次文章分享，数据已经准备得差不多了，师姐说可以先利用现有数据跑一个结果，然后再逐步增加想要的环境数据，改善结果。
另外，谨记师姐的一句话，环境因素不是随随便便就加上去的，要有自己实实在在的依据！！！

1 软件准备

本次使用maxent模型的软件，可以在官网上直接下载，需要Java的环境，网上有很多安装教程可以参考。
界面大概长这个样子：

2 数据准备

1、首先就是环境数据
经过（三）里面SPSS去相关后，将环境变量导入arcgis转换成asc格式。
SDMtool box里面的如图操作：

2、然后就是对发生记录进行处理
将发生记录转换成csv格式。（注意：若坐标为度分秒格式需要转换为十进制。可直接在Excel中用公式转，公式：=LEFT(A2,FIND(“°”,A2)-1)+MID(A2,FIND(“°”,A2)+1,FIND(“′”,A2)-FIND(“°”,A2)-1)/60+MID(A2,FIND(“′”,A2)+1,FIND(“″”,A2)-FIND(“′”,A2)-1)/3600）

3 运行模型

1、导入数据
左栏为发生数据
右栏为环境数据
左下部分为特征类型选择，是左右预测好坏的关键因素之一，很多论文中也是通过调试它的组合变化来寻找最佳预测结果。
右下部分：一般，刀切法( jackknife)、绘制响应曲线 ( response curves)和制作预测图（make picture of predictions）功能都勾选上。
预测分布选择的输出格式是logistic，其中的值是概率（介于0和1之间），可以解释为相对适用性。
最后选择输出文件夹就🆗

下一步点击setting进行参数设置。
我的设置如下：
【basic】
一般要勾选random seed
Random test percentage设置为30，意思是训练集为70%，测试集为 30%。
regularization multiplier 正则化参数是另一个左右预测好坏的参数，论文中一般在[0，5]区间内调试。
Replicates 重复 10 次运算，选择 ROC 值最大的一次运算结果进行预测。

【advanced】
这个界面的数据基本保持默认。
有时根据需要会勾选write plot data

点击run之后
漫长的等待等待等待。。。。。。
就有了这个文件夹，其中不带数字的为十次重复运行的平均。

因为重复运行十次，所以需要运行很长时间，文件夹也比较大，很占地方。

4 结果分析

依据 MaxEnt 模型模拟结果，将ASCII 数据导入ArcGIS 软件中，通 过 Conversion 工具转换为栅格数据，再利用Reclassify 工具，对物种的适生区等级进行划分。

将ASCII 格式文件转换为栅格数据

运行结果如下:

利用Reclassify 工具，对物种的适生区等级进行划分。

分类选择自然断点法；
分为四类：非适生区（P<0.08）、低度适生区（0.08≤P<0.25）、中度适生区（0.25≤P<0.47）、高度适生区（P≥0.47）。

最后结果如图所示：

就从结果图来看，不是很理想，看来还需要继续改变环境变量。