组学数据上传(六)|GEO数据库数据上传实操

本文手把手教你如何将组学数据上传至GEO数据库。首先,需在NCBI网站注册并登录账号,然后进入GEO数据上传页面选择数据类型。接着,准备metadata spreadsheet、processed data files和raw data files。使用FileZilla上传数据,并通过Notify GEO提醒审核。审核通过后,会收到包含GEO号的邮件,标志着数据上传成功。
摘要由CSDN通过智能技术生成

最近有些老师反馈文章发表时要求提供GEO登录号,如:GSEXXXX,问要怎么获取这种登录号?这时就需要把数据上传至GEO数据库了。还在等什么,跟着小编了解下GEO数据库,手把手教您上传数据至GEO数据库。

GEO数据库全称GENE EXPRESSION OMNIBUS,成立于2000年,是由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库,主要收录高通量基因表达数据除SRA数据库之外,GEO数据库也是目前文章投递数据上传的数据库之一。

接受数据类型:原始数据或者经过处理的数据(符合“有关芯片试验的最小信息(minimum information about a microarray experiment,MIAME)”标准)

存储数据格式:web格式、spreadsheets格式、XML格式和纯文本格式 

数据上传实操

01账号注册及登录

1)注册账号:进入https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 网页,找到页面右上角Sign in ,进入页面后,点击页面中的Sign up,根据自己喜好,选择对应的账号进行注册,按照提示填写账号、密码、邮箱等信息。

如果已有NCBI账号,此步骤可忽略。

图片

2)登录账号:输入账号及密码(注册时使用哪种账号注册,登录时选择对应的登录通道登录),点击Log in,然后点击左上角的NCBI大图标回到NCBI的主页,点击图中Submit按钮进入提交数据页面。

  • 0
    点赞
  • 2
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论
Elasticsearch 简介 ElasticSearch是一个基于Lucene的搜索服务器。它提供了一个分布式多用户能力的全文搜索引擎,基于RESTful web接口。Elasticsearch是用Java开发的,并作为Apache许可条款下的开放源码发布,是当前流行的企业级搜索引擎。设计用于云计算中,能够达到实时搜索,稳定,可靠,快速,安装使用方便。elasticSearch 的使用场景 1、在海量数据前提下,对数据进行检索。比如:京东,淘宝等电商项目课程目标: 1. 了解企业级搜索引擎2. 安装elasticsearch 课程目录: 01 课程介绍02 elasticsearch 简介03 elasticsearch 使用场景04 安装elasticsearch 之前先安装jdk05 安装elasticsearch06 测试elasticsearch是否安装成功 07 安装kibana08 elasticsearch 基本认识 以及添加索引和删除索引09 elasticsearch 添加查询数据10 elasticsearch 修改删除数据11 elasticsearch 有条件的查询12 分词子属性fuzzy查询13 elasticsearch 过滤使用14 elasticsearch 排序与分页15 elasticsearch 如何查询指定的字段16 elasticsearch 高亮显示17 elasticsearch 聚合18 elasticsearch mapping 概念19 elasticsearch 的中文词库20 elasticsearch 中文词库安装测试21 elasticsearch 中文词库的使用案例22 elasticsearch 自定义词库配置23 安装nginx 配置中文词库24 测试elasticsearch 自定义中文词库25 搭建项目父工程26 搭建项目bean-interface-common27 搭建search 的service web 项目28 测试项目是否能与elasticsearch联通29 创建数据库并搭建首页30 数据上传功能的实现类完成31 数据上传控制器完成32 dubbo 介绍以及安装zookeeper33 将数据从mysql 上传到elasticsearch 中34 elasticsearch查询功能分析35 编写业务需求的dsl 语句36 编写输入参数返回结果集的实体类37 实现类编写38 编写实现类中dsl 语句39 返回集结果转换40 结果测试41 测试通过输入查询条件并将数据显示到页面
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值