3D Slicer中安装MedSAM插件

MedSAM-Lite 插件简介

大家应该都读过这篇论文：《Segment Anything in Medical Images》
Nature地址：https://www.nature.com/articles/s41467-024-44824-z
aRxiv地址：https://arxiv.org/abs/2304.12306
这个插件便是该论文团队推出的在3D Slicer上使用的插件，可以分割医学图像的任何感兴趣区域。

安装步骤及注意事项

1.
在该插件 MedSAMSlicer 发行页上下载相关版本文件并解压到本地。

2.
打开3D Slicer软件，选择顶部工具栏中的Welcome to Slicer下拉菜单，然后转到Developer Tools > Extension Wizard。然后点击select Extension，然后在第2步中提取的文件和目录中找到“MedSAM”文件夹。如果要求添加新模块，请接受。
3.
点击左上角view

点击Extensions manager进入扩展，搜索pytorch并安装（后续会用到）。

4.
现在，在Welcome to Slicer下拉菜单下，Segmentation 子菜单下，会添加“MedSAMLite”选项。点击进入，在左边栏点击Install dependencies。

这时打开python console查看安装进度及报错（报错后再次点击install安装即可），直至安装成功出现如下界面

重新启动 3D Slicer进入查看，进入MedSAMLite选项出现如下功能即安装成功。