monophyly
中文:单系统,单系性
参考知乎上关于【对单系群、并系群、复系群概念的深入理解】
写得很详细,读完后的理解如下,先贴一张图
【本图来自知乎内容截图自行拼接】
我目前的理解是,如果最小共同祖先的性状与其祖先一致,是共同祖征,是并系群;如果最小共同祖先的性状与其祖先不一致,是共同衍征,是单系群。
如果是单系群,则具有单系性monophyly。
如Summary中的图,如果把字母想象为孩子,最小共同祖先想象为爸爸,那么主要是看爷爷的特征是否与爸爸一致。
ABC图中只显示到爸爸,因此没法确定是单系群,认为是并系群。
DEFGH可以看到爸爸是衍征2,爷爷是衍征1,爸爸与爷爷不同,所以DEFGH可以构成单系群。
JK可以看到爸爸是衍征1,爷爷是衍征1,爸爸和爷爷相同,所以是并系群。
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这里看一篇实际文献中用到单系性monophyly的例子,
Iyer LM, Aravind L, Koonin EV. Common origin of four diverse families of large eukaryotic DNA viruses. J Virol. 2001;75(23):11720-11734. doi:10.1128/JVI.75.23.11720-11734.2001
Common Origin of Four Diverse Families of Large Eukaryotic DNA Viruses - PMC
文章题目是Common Origin of Four Diverse Families of Large Eukaryotic DNA Viruses,四个不同家族的大型真核 DNA 病毒的共同起源
In addition, there was a weaker support for the monophyly of the animal viruses (poxviruses plus ASFV plus iridoviruses), to the exclusion of the phycodnaviruses, by six synapomorphies. 此外,动物病毒(痘病毒+ ASFV +虹色病毒)的单系性支持较弱,以6个突触形排除了藻病毒。
可以看到对应的三个黄色框没有出现明显的共同祖先【爸爸】,因此不能算为单系群,是单系性较弱的表现。
As expected, the monophyly of the so-called phycodnavirus clade (PBCV plus ESV) and the poxvirus clade (entomopox viruses plus chordopoxviruses) was strongly supported.正如预期的那样,所谓的藻病毒支(PBCV + ESV)和痘病毒支(虫痘病毒+ chordopoxvirus)的单系性得到了强有力的支持。
框中的+号代表增加的特征,-号代表减少的特征。
可以看到黄色框和绿色框分别是两个单系群,因为爸爸和爷爷的特征不同(有+号和-号),是单系性强的表现。
以上均为个人理解,如有不对,欢迎您批评指正,谢谢!!