基于PCA 和迭代 Canny Edge皮肤病变分割算法研究附Matlab代码

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⛄ 内容介绍

原位黑色素瘤(MIS)是被称为黑色素瘤的皮肤肿瘤的极早期阶段。近几十年来,黑色素瘤的发病率以每年2.6% 的速度增长,而MIS是造成这一增长的主要诊断物。识别MIS非常重要,因为在这一阶段(被称为表皮内阶段),癌细胞没有机会扩散到体内任何部位。由于从良性(无害)色素病变(比如正常胎块)中区分MIS非常具有挑战性,因此意大利雷焦艾米利亚的研究人员开展了本研究,考虑通过两种无创(即无需任何手术)方式来诊断皮肤癌,分别被称为反射共焦显微镜(RCM)和皮肤镜,看看能否利用它们来检测表皮内黑色素瘤。皮肤镜是一种价格低廉的方法,已在全球范围内应用20年之久:医生会使用一种被称为皮血管镜的手持设备来观察放大十倍左右的皮肤,以观看肉眼无法看到的东西。RCM是最近兴起的一种技术,但不太容易获得,可创建某部分皮肤的灰度等级图像,让医生在放大500倍左右的情况下观察异常。作者使用皮肤镜和RCM分析了120个MIS和213个痣(胎块),以识别与MIS诊断相关的一些特征(表皮内黑色素瘤的RCM形态尚不清楚)。然后在一个多步诊断算法中结合这些特征,这能够帮助医生决定给定的色素病变是否是早期黑色素瘤(评分≥2则意味着黑色素瘤),误差非常小。这种新型诊断算法易于应用,可能有助于医生诊疗。

⛄ 部分代码

idx_ed=find(img_ed);

B=mean(img_grad(idx_ed));

if out_on

    figure(8)

    imagesc(img_grad)

    colormap 'jet'

    hold on

    plot(edgs_y,edgs_x,'r.','MarkerSize',2)

    hold off

end

%% Annotate Original Image

f=figure(6);

imshow(img)

hold on

% plot(stats(minrgn).Centroid(1),stats(minrgn).Centroid(2),'rx', ...

%     'MarkerSize',20,'LineWidth',3)

plot(edgs_y,edgs_x,'r.')

hold off

title('Annotated Image')

an_array={['Asymmetry MSE: ' num2str(A)],...

    ['Border Strength: ' num2str(B)],...

    ['Color Standard Deviation: ' num2str(C)],...

    ['Diameter or Differential Structure',num2str(D)]};

text(10,10,an_array,'VerticalAlignment','top','FontSize',20)

TDS=A*1.3+B*0.1+C*0.5+D*0.5;

if TDS>5.45

msgbox(sprintf('CANCER DETECTED'),'Complete','Complete');

%return;

else

    msgbox(sprintf('NORMAL SKIN'),'','');

end;

    

%%if save_on

  %%  [~, name, ~]=fileparts(fname);

   %% print(f,'-djpeg','-r50',[name '.jpg'])

%%end

⛄ 运行结果

⛄ 参考文献

[1] Borsari S ,  Pampena R ,  Benati E , et al. 检测原位黑色素瘤的算法[J]. British Journal of Dermatology, 2018, 179(1):e77-e77.​

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【资源介绍】 基于HAM10000数据集实现皮肤癌分类python源码+使用说明.zip 这是一个用于训练图像分类模型的代码。在运行代码之前,用户需要安装以下依赖库:argparse, os, pandas, numpy, PIL, datasets, torchvision, tqdm和transformers。用户还需要从Hugging Face上下载所需的预训练模型。 参数说明 - `--metadata_path`:metadata文件的路径。默认为"./archive/HAM10000_metadata.csv"。 - `--images_dir`:图像文件夹的路径。默认为"./archive/HAM10000_images/"。 - `--model_dir`:预训练模型的路径。默认为"../model/vit-large-patch16-224-in21k"。 - `--checkpoints_dir`:保存检查点文件的文件夹路径。默认为"./checkpoints"。 - `--learning_rate`:学习率。默认为1e-5。 - `--batch_size`:批大小。默认为64。 - `--epochs`:训练轮数。默认为5。 - `--warmup_ratio`:预热步骤的比例。默认为0.1。 - `--split`:训练-验证数据集的分割比例。默认为0.8。 - `--gpu`:指定使用哪张GPU。默认为"0"。 - `--logging_steps`:每隔多少步记录一次训练日志。默认为50。 用户可以在命令行中传递这些参数,例如: ```shell python train-hf.py --metadata_path ./archive/HAM4000_metadata.csv \ --images_dir ./archive/HAM10000_images/ \ --checkpoints_dir ./checkpoints \ --learning_rate 1e-4 \ --batch_size 64 \ --epochs 20 \ --warmup_ratio 0.1 \ --model_dir ../model/vit-large-patch16-224-in21k \ --gpu 5,6,7 \ --logging_steps 1 ``` 在代码运行过程中,会执行以下步骤: 1. 读取metadata文件,获取图像文件名和标签。 2. 将图像读入内存,并随机打乱。 3. 将数据集划分为训练集和验证集。 4. 对图像进行预处理,包括随机裁剪、归一化和转换为tensor。 5. 加载预训练模型,构建分类器。 6. 训练模型,并在验证集上评估模型性能。 7. 在训练过程中,每隔logging_steps步记录一次训练日志,包括损失值、准确率等指标。 8. 在训练结束后,保存模型的权重文件到checkpoints_dir文件夹中。 【备注】 该项目是个人毕设/课设/大作业项目,代码都经过本地调试测试,功能ok才上传,高分作品,可快速上手运行!欢迎下载使用,可用于小白学习、进阶。 该资源主要针对计算机、通信、人工智能、自动化等相关专业的学生、老师或从业者下载使用,亦可作为期末课程设计、课程大作业、毕业设计等。 项目整体具有较高的学习借鉴价值!基础能力强的可以在此基础上修改调整,以实现不同的功能。 欢迎下载使用,也欢迎交流学习!
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