细胞STR鉴定之数据库比对

细胞STR的鉴定目的是确保细胞遗传身份的真实性与一致性，通过科学严谨的STR分型技术，实现对细胞系的准确鉴定、质量控制及合规性管理，支持生物医学研究、细胞治疗及生物制品开发的可靠性、安全性和透明度，同时促进科研诚信与伦理审查的严格遵循。

重要定义：

1.STR：全称短串联重复序列(Short Tandem Repeats)，是指在基因组DNA中重复出现的短序列，由长度为1~6个（也有说法认为是2~7个或3~7个）碱基对的短串连重复序列组成。这些重复序列广泛存在于人类基因组中，在不同个体之间，同一位点的重复次数可以有很大差异，这种变异使得STR成为非常有用的遗传标记，被称为细胞的DNA指纹。

2.细胞STR鉴定：即通过STR信息建立细胞系的遗传特性，主要基于多重PCR（聚合酶链式反应）结合荧光探针检测技术，对人源多个STR位点进行检测。通过对人源细胞特定数量（如21个）的STR位点进行检测，并与权威数据库进行比对，可以推算出样品所属的细胞系或可能的交叉污染的细胞系名称，从而检测细胞是否发生交叉污染现象。

那么，得到了STR的分型结果之后，如何进行数据库比对呢？这里展示ExPasy数据库的比对。

且看下方操作流程

1、登录ExPasy网址CLASTR

2、这里展示Example，也可以通过点击Load File自己导入位点分型文件，数据格式为GeneMapper分析软件的输出格式。

3、点击Search，得到比对结果，比对结果也可以点击【Export table】导出。

4、结果主要看第三列的匹配位点数和第四列的匹配得分Score，通常选择匹配位点数多且匹配得分高的结果。