GBD数据库相关文献中的EAPC怎么算?

本文介绍了如何使用GBD数据库进行疾病趋势分析,重点讲解了如何计算Estimated annual percentage change (EAPC),并建议使用R语言进行数据整理和分析,引用了相关文献和资源。
摘要由CSDN通过智能技术生成

发现近年来好多人利用GBD数据库发了很多文章。
GBD数据库(http://ghdx.healthdata.org/gbdresults-tool)中关于疾病的发生率、死亡率、DALY等数据都是现成的,所以主要的工作量包括:

  1. 下载数据并整理成表格:用R比较方便,用Excel也行;
  2. 数据的可视化(画图):用R的ggplot包比较方便,推荐参考书籍:
    Winston Chang. R数据可视化手册(异步图书)人民邮电出版社
  3. 相关变化趋势的计算:常用方法的是Estimated annual percentage change (EAPC),其原理推荐参考文献:
    Hankey BF, et al. Partitioning linear trends in age-adjusted rates. Cancer Causes Control CCC 2000; 11(1):31-5.
  4. 变化趋势的预测:见我的另一篇博文 《利用GBD数据库做未来疾病负担预测》

下面要讲的是EAPC的计算:

1. 数据的整理

以某病的年龄标准化发病率(ASIR)为例:

rm(list = ls())
library(data.table) #个人习惯,喜欢用这个包
library(tidyverse) #个人习惯,为了用管道符

years <- fread('I:/years_locations.csv')
regions_years_ASIR <- years[measure_name == 'Incidence' &  #发病率
                           age_name == 'Age-standardized' &  #年龄标准化的
                           metric_name == 'Rate' & #率(每10万人)
                           location_id 
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