结构生物学
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黑曜、
这个作者很懒,什么都没留下…
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Coot 简单操作图文详解
coot的简单应用,使用教程。翻译 2022-09-14 18:01:37 · 4096 阅读 · 0 评论 -
PyMOL简单操作图文介绍
关于PyMoL简单的命令行操作及鼠标操作。PyMOL可以参考这篇文章:https://cloud.tencent.com/developer/news/338169提示:以下是本篇文章正文内容,下面案例可供参考一、pandas是什么?示例:pandas 是基于NumPy 的一种工具,该工具是为了解决数据分析任务而创建的。二、使用步骤1.引入库代码如下(示例):import numpy as npimport pandas as pdimport matpl原创 2022-09-09 17:35:09 · 2664 阅读 · 0 评论 -
Discovery Studio Visualizer简单操作
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分子对接及结果分析在线工具
简单介绍GRAMM,ZDOCK和PDBePISA分子对接及结果分析的流程。原创 2022-09-08 10:59:54 · 14067 阅读 · 3 评论 -
Phenix图文流程:使用docking解决Cryo-EM数据的结构问题
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Coot Cryo-EM教程2:Fitting和Mutating
Coot Cryo-EM教程2:Fitting和Mutating翻译自:https://pemsley.github.io/coot/blog/2020/10/20/Coot-Cryo-EM-main.html本教程专为0.9.1或更高版本而设计。目的:我们将fit Cleavage and Polyadenylation Factor的domain1: Setting Up1.1 Fetch the Files使用Web浏览器下载EMD-3908 bundle:http://www.ebi翻译 2021-09-09 16:23:22 · 7532 阅读 · 0 评论 -
ChimeraX cryoEM 可视化教程:细菌ATP合酶
ChimeraX cryoEM 可视化教程:细菌ATP合酶翻译自:https://www.rbvi.ucsf.edu/chimerax/data/stanford-jul2019/tutorial.html这篇ChimeraX教程将着眼于如何可视化细菌ATP合成酶在3.0和3.2 A分辨率下由CryoEM测定的三种构象的原子模型和maps。我们将创建与2019年2月出版物中类似的数据视图。原子模型PDB 6n2y、6n2z、6n30。EMDB map 9333,9334,9335。ChimeraX翻译 2021-09-04 15:12:51 · 4983 阅读 · 0 评论 -
Chimera的简单应用_图文流程
UCSF Chimera的简单应用翻译自:https://dasher.wustl.edu/bio5357/software/chimera/chimera-getting-started.pdfFetch打开 File→Fetch by ID and type 1zik in the PDB ID field1zik是由两个肽形成的亮氨酸拉链: Presets→Interactive 2 (all atoms)应用交互式预置#2,这将按元素显示除碳以外的所有原子和颜色代码原子(氧红色、翻译 2021-08-28 11:04:23 · 9699 阅读 · 0 评论