BZOJ 1264 树状数组+DP 解题报告

1264: [AHOI2006]基因匹配Match

Description

基因匹配（match） 卡卡昨天晚上做梦梦见他和可可来到了另外一个星球，这个星球上生物的DNA序列由无数种碱基排列而成（地球上只有4种），而更奇怪的是，组成DNA序列的每一种碱基在该序列中正好出现5次！这样如果一个DNA序列有N种不同的碱基构成，那么它的长度一定是5N。 卡卡醒来后向可可叙述了这个奇怪的梦，而可可这些日子正在研究生物信息学中的基因匹配问题，于是他决定为这个奇怪星球上的生物写一个简单的DNA匹配程序。 为了描述基因匹配的原理，我们需要先定义子序列的概念：若从一个DNA序列（字符串）s中任意抽取一些碱基（字符），将它们仍按在s中的顺序排列成一个新串u，则称u是s的一个子序列。对于两个DNA序列s1和s2，如果存在一个序列u同时成为s1和s2的子序列，则称u是s1和s2的公共子序列。 卡卡已知两个DNA序列s1和s2，求s1和s2的最大匹配就是指s1和s2最长公共子序列的长度。 [任务] 编写一个程序：  从输入文件中读入两个等长的DNA序列；  计算它们的最大匹配；  向输出文件打印你得到的结果。

Input

输入文件中第一行有一个整数N，表示这个星球上某种生物使用了N种不同的碱基，以后将它们编号为1…N的整数。 以下还有两行，每行描述一个DNA序列：包含5N个1…N的整数，且每一个整数在对应的序列中正好出现5次。

Output

输出文件中只有一个整数，即两个DNA序列的最大匹配数目。

Sample Input

2
1 1 2 2 1 1 2 1 2 2
1 2 2 2 1 1 2 2 1 1

Sample Output

7

HINT

[数据约束和评分方法]
60%的测试数据中：1<=N <= 1 000
100%的测试数据中：1<=N <= 20 000

代码如下：

#include<cstdio>
#include<cstring>
#define N 100005
#define lowbit(x) (x&(-x)) 
#define max(a,b) ((a>b)?a:b)
#define min(a,b) ((a<b)?a:b)

int n,ans;
int a[N*5],b[N*5],c[N*5],f[N*5],pos[N][7];

void update(int x,int y)  
{  
    c[x]=max(c[x],y); 
    while(x<=n*5) x+=lowbit(x),c[x]=max(c[x],y); 
}  
int getans(int x)
{
    int rt=max(rt,c[x]);
    while(x) x-=lowbit(x),rt=max(rt,c[x]);
    return rt;
}
int main()
{
    scanf("%d",&n);
    for(int i=1;i<=5*n;++i)
    {
        scanf("%d",&a[i]);
        pos[a[i]][++pos[a[i]][0]]=i;
    }
    for(int i=1;i<=5*n;++i)
        scanf("%d",&b[i]);
    for(int i=1;i<=5*n;++i)
    for(int j=5;j;--j)
    {
        int k=pos[b[i]][j];  
        f[k]=max(f[k],getans(k-1)+1);  
        update(k,f[k]);  
        ans=max(ans,f[k]);  
    }
    printf("%d\n",ans);
    return 0;
}