基于结构药物合计对HDAC6抑制剂的研究

• 摘要：本文主要研究新的组蛋白脱乙酰基酶6(HDAC6)抑制剂，来调节由tau 蛋白引起的疾病。作者通过DS中的CBP模块建立了药效团模型，通过药效团模型（Hypo1）对ZINC数据库中的分子进行筛选。首先通过ROF和ADMET对ZINC数据库进行第一次筛选，然后通药效团模型再次筛选得到了841个分子，进行分子对接，通过分析打分值以及相互作用模式挑选出11个分子，最后进行分子动力学的模拟，最终选出了3个作为HDAC6的候选抑制剂。

药效团模型（Pharmacophore）：是指药物活性分子中对活性起着重要作用的“药效特征元素”及其空间排列形式，可以认为是大量活性化合物共同的成药特征。基于药效团模型，科研人员可以进行快速的药物虚拟筛选工作，寻找结构新颖的活性分子；也可以解释化合物的构效关系，进行化合物的结构优化与改造；此外，还可以进行化合物靶标的识别，实现反向找靶。Discovery Studio中的Catalyst模块，是经典的药效团模型生成、验证及虚拟筛选的工具，可以基于配体、受体以及复合物结构进行定量、定性的药效团模型研究。

基于结构药物合计对HDAC6抑制剂的研究

ref：ACS Chemical Neuroscience 

IF=4.211

链接：10.1021/acschemneuro.8b00405   

组蛋白去乙酰化酶可调节与细胞生长，转移，凋亡相关的多种细胞途径。HDAC6是HDACs的一种研究最为广泛的亚型。HDAC6抑制剂在治疗阿尔兹海默症，脑胶质瘤及神经保护方面的作用也越来越收到关注，目前HDAC6的抑制剂几位有限，而且目前已上市的药物有很大的副作用，研究新的HDAC6抑制剂是非常必要的。本文通过DS中的CBP模块建立了药效团模型，通过药效团模型（Hypo1）对ZINC数据库中的分子进行筛选。首先通过ROF和ADMET对ZINC数据库进行第一次筛选，然后通药效团模型再次筛选得到了841个分子，进行分子对接，通过分析打分值以及相互作用模式挑选出11个分子，最后进行分子动力学的模拟，最终选出了3个作为HDAC6的候选抑制剂。

 

 

 

图一 基于受体配体复合物产生的药效团模型及筛选出的药效团模型（Hypo1）。

 

图二 筛选出的分子以及对照分子与HDAC6的相互作用分析

MaXFlow分子模拟与人工智能平台

MaXFlow生物医药智能创新平台，由创腾科技自主研发，旨为不同领域的一线创新科技工作者提供一个合作共享的B-S架构平台。以“数据自由，模型自由”为理念，在结构模型与预测模型进行融合的基础上，实现模拟与AI需求的合并，为研发赋能。