摘要:本文主要研究一种全新的喹啉类抑制剂,通过实验的方法进行合成了一系列喹啉类衍生物,并通过实验验证了28号化合物对于拓扑异构酶1具有很好的抑制效果,28号化合物的化学性质比较稳定,之后通过DS中Libdock,ADMET性质预测,进一步解释了28号化合物与拓扑异构酶1的结合方式,找到并验证了ASN722号氨基酸为28号化合物与拓扑异构酶1结合的关键氨基酸。
分子对接(molecular docking)是基于结构药物设计的核心模拟手段,依据受体与配体作用时的几何匹配和能量匹配过程,模拟受体-配体相互作用,预测两者间最佳的结合模式和结合亲和力。采用分子对接模拟技术,科研人员可以进行基于结构的药物虚拟筛选,药物分子的结构改造,药靶相互作用的机理研究等工作,从而大大提高实验效率。在Discovery Studio这一分子模拟的综合平台中,共有四种对接程序,包含Libdock、CDOCKER、FlexibleDocking,这三种对接算法各有优势,能够满足广大科研工作者的多种应用需求,为其提供配体受体间相互识别的“利器”。
一种全新的对拓扑异构酶1具有抑制作用的喹啉类药物的研究
ref:Journal of Medicinal Chemistry;IF=6.045
链接:10.1021/acs.jmedchem.8b01938
拓扑异构酶是一种普遍存在的酶,是解决DNA在复制和转录过程中发生超螺旋的拓扑问题所必需的酶。拓扑异构酶1可以作为治疗肿瘤的一个重要靶标。喜树碱(CPT)是一种细胞毒性喹啉生物碱,可以选择性的抑制Top-1的活性,但是由于CPT及其衍生物结构存在不稳定性因素,所以开发新的Top1的抑制剂有很重要的意义。本文主要研究一种全新的喹啉类抑制剂,通过实验的方法进行合成了一系列喹啉类衍生物,并通过实验验证了28号化合物对于拓扑异构酶1具有很好的抑制效果,28号化合物的化学性质比较稳定,之后通过DS中Libdock,ADMET性质预测,进一步解释了28号化合物与拓扑异构酶1的结合方式,找到并验证了ASN722号氨基酸为28号化合物与拓扑异构酶1结合的关键氨基酸。
图一28号化合物与TOP1的结合模式,找到了关键氨基酸ASN722。
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