通过反向对接的方法筛选triclosan新靶标的研究

摘要：本文通过运用Discovery Studio中的CDOCKER方法，将triclosan对接到226个受体蛋白中，寻找triclosan的潜在靶标，最终找到了Receptor-interacting protein 1 (RIP1), Apoptosis signal-regulating，kinase 1 (ASK1) and B-cell lymphoma 2 (Bcl-2)三个受体蛋白与triclosan的对接打分分别为-26.88, -23.34，-22.96 kcal/mol。可以作为triclosan的靶标蛋白进而研究triclosan在人体中引起疾病的机理。

分子对接（molecular docking）是基于结构药物设计的核心模拟手段，依据受体与配体作用时的几何匹配和能量匹配过程，模拟受体-配体相互作用，预测两者间最佳的结合模式和结合亲和力。采用分子对接模拟技术，科研人员可以进行基于结构的药物虚拟筛选，药物分子的结构改造，药靶相互作用的机理研究等工作，从而大大提高实验效率。在Discovery Studio这一分子模拟的综合平台中，共有四种对接程序，包含Libdock、CDOCKER、FlexibleDocking，这三种对接算法各有优势，能够满足广大科研工作者的多种应用需求，为其提供配体受体间相互识别的“利器”。

通过反向对接的方法筛选triclosan新靶标的研究 

ref：Chemosphere 235 (2019) 976-984；IF=5.108

链接：https://doi.org/10.1016/j.chemosphere.2019.07.027

内分泌干扰物(EDCs)是一类具有多种调节内分泌系统潜能的合成物质，通过多种途径调节内分泌系统，对人类和野生动物产生广泛的不良影响，三氯生(TCS)的化学名称为5-氯-2-(2,4-二氯酚)苯酚，是一种水不溶性物质。TCS作为一种合成抗菌剂在全球使用了40多年。TCS通常用作去污剂、防腐剂或防腐剂，也用于个人护理产品，如洗手液、除臭剂、洗发水、化妆品和洗衣粉。在家庭用品以及医疗器械中也检测到TCS。从各种毒理学数据中可以明显看出，TCS对内分泌功能和甲状腺激素的稳态有很强的影响，这是由于TCS与芳烃和性激素受体都有很强的相互作用。因此，它可能被认为是一种潜在的内分泌干扰物。研究有表明TCS对肿瘤的发生有重要的作用，同时毒理学数据也表明TCS对预防癌症的发生起着重要作用。三氯生与所有通路蛋白的相互作用亲和性评价是生物学家研究的难点和难点。本文通过运用Discovery Studio中的CDOCKER方法，将TCS对接到226个受体蛋白中，寻找TCS的潜在靶标，最终找到了Receptor-interacting protein 1 (RIP1), Apoptosis signal-regulating，kinase 1 (ASK1) and B-cell lymphoma 2 (Bcl-2)三个受体蛋白与TCS的对接打分分别为-26.88, -23.34，-22.96 kcal/mol。可以作为TCS的靶标蛋白进而研究TCS在人体中引起疾病的机理。

 

图一 TCS的化学结构

 

图二 TCS反向对接的结果

 

图三 TCS与RIP1的结合模式

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