Genome Browser使用方式札记

应该会持续更新，因为目前还搞不懂这些文件的作用，捂脸

安装步骤介绍：

-->1:安装docker

sudo apt-get update
sudo apt-get install docker.io
docker --version

-->2:获取NGB.git

git clone https://github.com/epam/NGB.git

-->3:进行构建

cd NGB
./gradlew buildDocker

-->4:确认一下已经dokcer中已经有了名称为ngb:latest的镜像仓库

docker images ls

-->5:基于已有的ngb:latest镜像运行NGB

docker run -p 8080:8080 -d --name ngbcore -v /home/2tong:/ngs ngb:latest

Tips:其中，ngbcore时可以随意更改的，/home/2tong是可以随意更改的

-->6:打开浏览器，键入http://localhost:8080/catgenome

-->7:注册数据到ngb

docker exec -it ngbcore /bin/bash
ngb reg_ref /ngs/<Path to FASTA> -n my_genome -t
ngb reg_file my_genome /ngs/<Path to File> -n my_file1 -t
ngb reg_dataset my_genome my_sample_dataset my_file1
exit

通过增加my_file2，my_file3等，可以增加这个dataset所包含的