《Netlogo多主体建模入门》笔记 10

10- 网络上病毒传播的SIR模型 用Links建模网络动力学

该系列笔记基于集智乐园的《Netlogo多主体建模入门》课程，感谢张江老师与各位志愿者的辛勤付出。

• 集智乐园 《Netlogo多主体建模入门》 https://campus.swarma.org/play/play?id=429

 

 

 

首先，我们需要知道SIR模型是什么。

 

经典的SIR模型：

感染者有α 的概率感染健康者，

感染者有β的概率治疗成功，恢复之后就不会再被感染（neilogo的模型中是：痊愈后有一定的概率会获得病毒抗性）。

将人群分成三种状态：

S: 易感态、疑似态（Susceptibility）

I: 感染态（Infection）

R: 恢复态（Recovery）

三种状态彼此之间可以以一定的概率彼此之间相互转换

 

感染态可以沿着网络进行传播。

 

 

实现思路：

 

• 随机放置节点，遍历turtles，在半径r 内的节点都和该 turtle 相连；

• 使用 layout-spring 函数进行可视化；
• 患者有一定概率传染给健康者，患者在患病初期并不知道自己感染，患者有一定几率痊愈
• 患者痊愈后，有一定的概率会获得病毒抗性。对病毒产生抗性的患者无法被感染。
• 获得病毒抗性的人标记为灰色，并标记连边为灰色，记作无效节点
• 能选定初始的节点数、平均度、传播源点数

• 能指定传播速度、患者自检频率、痊愈比例、获得病毒抗性的比例

 

预备的代码知识：

 

Link对象

属性：

• end1,end2 属性

代表link两端的节点，end1代表起点，end2代表