HDU-#1560 DNA sequence(迭代加深搜)

题目大意:给出n个DNA序列,求包含这n个子序列的公共序列的最短长度。

解题思路:由于每次搜索长度未知,因此可以采用迭代加深搜,先将最长的子序列长度作为初始的深搜长度,之后满足条件则进行+1迭代。直到搜索完所有子序列,然后输出deep。这里的迭代加深搜与IDA*很类似了,如果将下面的check_lenth()函数作为IDA*的h()代价函数,就是IDA*算法了,但是这样的效果应该不是很好,应该可以更加优化代价函数,感兴趣的可以尝试下。详见code。

题目来源:http://acm.hdu.edu.cn/showproblem.php?pid=1560

code:

#include <iostream>
#include <cstdio>
#include <cstring>
#include <algorithm>
using namespace std;

char DNA[]={"ACGT"};
int n,t,deep;
int pos[10];
bool flag;

struct node{
    char str[6];
    int lenth;
}a[10];

int check_lenth(){
    int check=0;
    for(int i=1;i<=n;i++)
        check=max(check,a[i].lenth-pos[i]);
    return check;
}

bool DFS(int k){
    int check=check_lenth(); //记录当前还可以使用的最大长度
    if(check+k>deep) return false;  //如果已经使用长度+还可以使用的最长长度大于迭代深度,则返回
    if(check==0) return true;
    for(int i=0;i<4;i++){
        int temp=0;
        int tmp[10]; //中间数组,用于保存当前状态,用于还原信息
        for(int j=1;j<=n;j++) //记录当前状态信息
            tmp[j]=pos[j];
        for(int j=1;j<=n;j++){ //进行列向扫描
            if(a[j].str[pos[j]]==DNA[i]){  //进行匹配
                temp=1;
                pos[j]++;
            }
        }
        if(temp){ //有符合的则向下搜索
            if(DFS(k+1)) return true; //进行迭代
            else for(int j=1;j<=n;j++) //没有匹配则还原之前的状态
                pos[j]=tmp[j];
        }
    }
    return false;
}

int main(){
    scanf("%d",&t);
    while(t--){
        int maxx=-1;
        scanf("%d",&n);
        for(int i=1;i<=n;i++){
            scanf("%s",&a[i].str);
            a[i].lenth=strlen(a[i].str);
            pos[i]=0; //访问位置置0
            maxx=max(maxx,a[i].lenth);
        }
        deep=maxx; //获取序列中最大长度作为初始的迭代深度
        while(1){
            if(DFS(0)) break;
            deep++;  //每次迭代深度++
        }
        printf("%d\n",deep);
    }
    return 0;
}


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