Linux下的she'll script

        今天对医学图像的处理需要用到Linux下的dcm2nii和nifti2dicom，这两个是开源的软件，专门用于处理医学图像格式，前一个时将dicom格式的文件转换为nii格式，后一个是将nii格式转换为dicom格式。

        这两个软件安装好了之后，都可以在命令行进行执行，很方便。但是为了实验需要，要在Java中调用Linux命令来进行转格式。先尝试写一个she'll脚本，运行这个脚本的时候就可以完成格式转换。

she'll的编写： 以test.sh为例

1、touch test     创建一个文件test

2、vim test         开始便捷test这个文件

#!/bin/bash
#Transform type of nii to dicom，then find the filename.nii.gz image's name , rename ,unzip it to filename.nii
#20170225
dcm2nii -a y ......nii2dcm/N2D_0001.dcm
name=`find -name *.gz`
echo "\nfilename: $name" 
arr=$(echo $name|tr "/" "\n")
for x in ${arr[@]}; do
  echo