R语言 关联TCGA数据库下载的RNA-SEQ数据和临床信息

刚开始学习TCGA数据处理和分析，记下来方便以后查看   

setwd("E:/MyData/luadRNA-SEQ-20201028") #把工作目录定位到manifest文件所在的位置
manifest= "gdc_manifest.2020-10-28.txt"
x=read.table(manifest,header = T) #header为TRUE表示读取第一行作为变量名

  表格已经建好了，可以view(x)，发现长这样

接下来定义两个变量，一会儿要用：

manifest_length= nrow(x) #行数
id= toString(sprintf('"%s"', x$id))

接下来运行脚本：（提取自https://docs.gdc.cancer.gov/API/Users_Guide/Search_and_Retrieval/）

Part1= '{"filters":{"op":"in","content":{"field":"files.file_id","value&#