1.登录TCGA数据获取网站:https://portal.gdc.cancer.gov/。搜索GBM,选择TCGA-GBM
2.选择下载的数据类型:(我需要下载的是RNA-Seq数据)。鼠标右键点击打开新页面
3.对数据进行进一步筛选:(可根据自己需求筛选)
4.将所有文件添加到购物车:(购物车中的可直接下载,无需登录)
5.点击下载即可:
6.下载完成,数据内容展示(174个文件的其中一个文件):
RNA-seq数据中包含gene_type挺多的,需要选出lncRNA
(这是后面需要处理的部分,下载工作到这里就完成了)