分子翻译-将化学图像转换为文本

1. 比赛概览分析

比赛地址
数据集下载 提取码:15nr

1.1 标签格式介绍

在这里插入图片描述

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上面的字符串是 系统给的标签,需要进行分词进行打标签,即形成字典的形式,每个原子以及数量形成dict

挑战1:特征图太小,会损失很多细节信息,如右下角图像;如果太大,则会占用很大的硬件资源

在这里插入图片描述
挑战2:多大的输入尺寸是最好的
在这里插入图片描述
尺寸分布如下图
在这里插入图片描述
训练集包含的分子如下图所示
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数据集中加入了噪声和高斯噪声,如小黑点,断断续续的线,高斯模糊(可使用简单的方式将图像变得清晰)
在这里插入图片描述

1.2 评价指标

在这里插入图片描述
编辑距离:将字符串转化为目标字符串使用的步数

1.3 训练

2080ti训练一个epoch需要12个小时,需要训练5天左右;1080ti的时长需要乘1.5

2. Baseline

在这里插入图片描述
特征提取网络越强,越利于lstm的训练,好的特征提取网络比如efficientNet
图中使用的是resnet26d
在这里插入图片描述

data$ tree . -L 2
.
├── bms-molecular-translation
│   ├── df_test.csv
│   ├── df_train.csv
│   ├── sample_submission.csv
│   ├── test
│   ├── train
│   └── train_labels.csv
├── df_test.pkl
├── df_train0.pkl
├── df_valid0.pkl
├── test_orientation.csv
└── tokenizer.stoi.pickle
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