FSL里的FAST工具(FMRIB’s Automated Segmentation Tool)
如果读过很多论文的话,知道很多时候都避免不了分割操作。比如,将大脑组织分割成白质和灰质,然后再送到神经网络里去训练,提高精度。FAST就是这样的工具——可以将大脑的三维图像分割成不同的组织类型(灰质、白质和脑脊液)
需要先进行大脑提取
BET brain extraction 是FSL中的第一个菜单项,使用起来很简单。生成的图像如下所示:
分割出白质、灰质和脑脊液
Number of classes默认为3,就是脑脊液、灰质和白质三类,一般不用修改。其他也基本上用默认的,若是有什么不明白的可以留言。
单击Go需要等一段时间,这是令人不爽的地方。然后就会在相同的文件夹下生成以a1_brain开头的文件,如下图: