CATH标识符解读

在CATH数据库中，标识符如1a0rB00、1a0rP01、1a0rP02代表的是蛋白质结构的具体信息，主要涉及PDB编号、链ID以及结构域。让我们具体解释这些标识符的含义。

CATH标识符的组成

CATH标识符通常由以下几个部分组成：

• PDB ID：代表蛋白质结构的PDB编号（4位字母或数字）。
• Chain ID：代表该蛋白质结构中的链ID（通常是单个字母或数字，表示特定的多肽链）。
• Domain ID：代表CATH系统对蛋白质链中不同结构域的编号。

让我们分别解释你提到的三个标识符。

1a0rB00的解释

• 1a0r：这是PDB ID，表示蛋白质结构1a0r，该结构可以在PDB数据库中找到。
• B：这是链ID，表示PDB结构1a0r中的B链。
• 00：表示这个链B整体被认为是一个单一的结构域，没有进一步的划分。

因此，1a0rB00表示PDB结构1a0r中B链的整体，该链没有进一步细分成多个结构域。

1a0rP01的解释

• 1a0r：PDB ID，表示蛋白质结构1a0r。
• P：链ID，表示该结构中的P链。
• 01：表示该链中被CATH划分出的第一个结构域。

因此，1a0rP01表示PDB结构1a0r中P链的第一个结构域。

1a0rP02的解释

• 1a0r：PDB ID，表示蛋白质结构1a0r。
• P：链ID，表示该结构中的P链。
• 02：表示该链中被CATH划分出的第二个结构域。

因此，1a0rP02表示PDB结构1a0r中P链的第二个结构域。

总结

• 1a0rB00：表示PDB结构1a0r中B链的整体，未进一步划分为多个结构域。
• 1a0rP01：表示PDB结构1a0r中P链的第一个结构域。
• 1a0rP02：表示PDB结构1a0r中P链的第二个结构域。

CATH数据库对蛋白质链进行结构域的划分，以便更好地理解和分析蛋白质的三级结构和功能模块。