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原创 蛋白质结构比较
一、题目要求对Swiss-Model和Modeller建模结果进行VMD可视化比较二、操作过程记录及结果RMSD比对模型间比对选取多模板建模出来的两个结果,使用VMD的RMSD Tool,对1-630全部氨基酸,计算出RMS deviations:8.02,VMD可视化看得出来两个结果如同重影一般,非常相近。图表 1 1-630RMSD比对接下来,依次对12
2017-04-07 21:13:35 10296 1
原创 蛋白质结构预测(swiss-model,modeller )
用swiss-model (3 models)和modeller (6 models)分别预测给定序列的结构,并用PROCHECK,Molprobity,Errat, Verify_3D分别评价所得预测模型,详细注释所得结果依据打分情况,选出最佳的模型,说明理由。 建模注意事项:了解本序列的结构组成(有几个结构域,分别是什么结构域……)有针对性选择合适的模板进行建模最后选出的最优模型用VMD显示三维结构,并注明每个结构域的位置
2017-04-07 20:39:49 83795 25
微信小游戏大小猜猜看python自动化答题
2020-04-04
使用fsl进行MRI脑图像分析
2019-10-09
真核生物基因组的基因分析和预测相关代码
2018-07-17
空空如也
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