疗效预测中的影像组学特征提取

介绍

最近一直在做关于肿瘤的放疗疗效预测相关的工作，遇到了一些问题主要是关于影像组学特征提取相关的问题，在这里做一个总结，主要是关于基于python提取影像组学特征：

需要的module：

主要需要的是SimpleITK，NRRD和pyradiomics这几个包，安装的话直接pip就可以

pip install pyradiomics
pip install SimpleITK
pip install pynrrd

 具体流程：

因为我们收到的数据都是图像是dicom格式的，标注为nii格式的，但是pyradiomics这个包，他说明只支持nrrd格式的输入，所以前期我们踩了大量的坑，思路都停留在将dicom和nii格式的数据转换为nrrd格式的数据，但是一直都是会缺少部分信息，最近才有部分进展，现在的流程如下：

1. 使用ITK-SNAP这个软件将nii格式的标注转换为nrrd格式的数据，过程很简单只需要将nii文件打开，选择file-save image-main image即可，然后再弹出框中选择nrrd格式，即可在对应文件目录下生成一个对应格式的标注文件